Python脚本提取氨基酸序列的 因子复杂度
定义 函数如下:
def fac_cpx(w):keep_str = []for j in range(len(w)+1):for i in range(len(w)-j+1):keep_str.append(w[i:i+j])keep_str = list(filter(None,keep_str))keep_str_set = set(keep_str)keep_str_sorted = sorted(keep_str_set,key = lambda i:len(i),reverse=False)keep_num = []for i in range(1,len(w)+1):temporary_list =[]for j in range(len(keep_str_sorted)):if len(keep_str_sorted[j]) == i:temporary_list.append(keep_str_sorted[j])keep_num.append(temporary_list)fac_num = []for i in range(len(keep_num)):fac_num.append(len(keep_num[i]))return fac_num
“INPVQQQNQIGYPQPYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSSAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPSGYRVAGYETQ”为例,得到结果如下:
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