eeglab中文教程系列(2)-绘制脑电头皮图
目录
- 绘制脑电头皮图
- 第一步:加载通道位置信息文件
- 第二步:点击"Read locations"按钮,并选择通道位置文件:
- 第三步:可视化通道位置
本教程为脑机学习者Rose发表于公众号:脑机接口社区 .QQ交流群:903290195
一般要绘制2D或3D的脑电头皮图,或者估计数据成分的源位置,必须要保证EEG数据集中包含记录电极头皮位置信息的文件。
绘制脑电头皮图
第一步:加载通道位置信息文件
在eeglab plot界面上进行如下操作:Edit > Channel locations.
如果以Neuroscan或BioSemi格式导入二进制数据文件,则通道标签将已存在于数据集中(在EEGLAB v4.31及更高版本中)[数据也发在QQ群:903290195,方便下载]。调用通道编辑窗口时,将出现一个对话框(如下所示),询问是否要使用基于扩展国际10-20系统的通道位置文件中导入的电极位置标签(例如“FZ”)的标准通道位置。
如上图,可以在多个模板之间选择,如果要执行本地源,建议选择第二项"为BEM Dipfit模型选择使用MNI坐标"(第一组"BESA"坐标是为球形BESA头模型设计的,现已淘汰)。点击OK,出现如下界面:
第二步:点击"Read locations"按钮,并选择通道位置文件:
“eeglab_chan32.locs”,加载通道文件。(位于eeglab发行版的sample_data子目录中)
在下一个弹出窗口中,只需按"OK"。如果不指定文件格式,pop_chanedit.m函数将尝试使用文件扩展名来评估其格式。按主通道图形界面窗口中的"Read locs help"按钮可查看支持的格式。
点击OK后,就跳转到下面的界面,此时,已加载的通道标签和极坐标显示在下面界面(pop_chanedit.m窗口)中,建议使用默认设置。[绘制在头部动画外部的电极是位于头部中线以下的电极(即,负z(高度)坐标,0是头部的中心).按照惯例,它们被绘制在头部卡通的外面。想要仅在头部动画中绘制头皮图,就需要在"Plot radius"编辑框中输入0.5。在这种情况下,当计算用于显示或9在某些情况下)进一步处理的插值二维头皮图时,将不显示或不考虑两个眼睛电极。这些设置用于在eeglab中绘制的所有头皮地形图。也可以将此对话框设置为1.0,以进行插值并显示包括所有可能的头皮通道位置的头皮图,并且头的部分在(0.5)头部赤道下方,显示在卡通头部边界外的 ‘skirt’ 或 'halo’区域中(更精确地控制要绘制的通道位置可从命令行获得:请参阅头皮图绘图功能topoplot.m的"Help"。)]
在上面的窗口中,可以点击< 和 > 来增减1 ,也可以使用<< 和 >>来前进或后退10。
第三步:可视化通道位置
在上图中点击OK后,可以直接在eeglab界面处进行如下操作:
Plot > Channel location > By name
点击上图中任何标签都可以查看其对应的通道号。
也可以绘制成数字形式(数字对应的是通道号):
Plot > Channel location > By number
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