无论如何获得先导化合物,评估候选先导化合物的合成难度都很重要。无论该化合物在计算机上的应用前景如何,实际上并未对其进行合成和评估。

介绍SA score(Synthetic Accessibility score)作为评估化合物合成难易程度的一种方法。


药物研发中合成难度评估的重要性

药物发现研究中的主要候选化合物:

  • 预期的活性值
  • 结构新颖,易于申请专利

如果化合物是从商业产品或内部数据库获得,则“合成潜力”得到保证。另一方面,尚不清楚是否可以实际合成复杂的天然化合物或从头设计的化合物。

无论如何,在研究的某个阶段都必须考虑化合物的“易于合成”。在这种情况下,如果优先考虑其他指标(例如活性)并在最后考虑“合成的难易程度”,则倾向于选择具有相似化学型和骨架的化合物。为了防止这种情况,期望从筛选的初期就通过均等地处理“合成可及性”来评价化合物。换句话说,用一种简单的方法来评估大量化合物的“合成容易性”很重要。

经验丰富的合成化学家可以通过查看化合物的结构来确定合成的难度,但是它不能解决数百万种化合物的筛选问题。因此,有必要使用计算机来评估“合成的容易性”。

计算机辅助合成难度评估方法

  • 基于分子结构复杂性的方法
  • 基于逆合成分析的方法

RDKit | 通过评估合成难度(SA Score)筛选化合物相关推荐

  1. J. Med. Chem. | 通过负向设计优化筛选化合物库

    今天给大家介绍的是2020年1月在Journal of Medicinal Chemistry上发表的综述"Application of Negative Design To Design ...

  2. 从产物追溯研发合成路线?自建化合物数据库溯源不再成难题

    从产物追溯研发合成路线?自建化合物数据库溯源不再成难题 相信大家在刚接触到化合物管理软件时,都会思考像这样的问题:它的作用是什么呢?应用这样一个私有化的数据库可以帮到我什么呢? 信息化管理软件已经慢慢 ...

  3. RDKit | 定量评估类药性(QED)

    QED(quantitative estimate of drug-likeness)是一种将药物相似性量化为介于0和1之间的数值的方法. 药物相似性 如Lippinsky规则所示,获批药物的理化参数 ...

  4. JMC | 人工智能在药物发现中的应用:走进广阔的天地

    JMC推出 "Artificial Intelligence in Drug Discovery "特刊,强调人工智能(AI)在制药研究中的新兴作用.本期的一个焦点是阐明人工智能方 ...

  5. 【2023华中杯数学建模】B 题 小学数学应用题相似性度量及难度评估详细建模方案及实现代码

    更新时间:2023-5-1 14:00 1 题目 B 题 小学数学应用题相似性度量及难度评估 某 MOOC 在线教育平台希望能够进行个性化教学,实现用户自主学习.在用户学习时,系统从题库中随机抽取若干 ...

  6. MCE公司:你所不知道的 MCE--光反应赖氨酸的高难度合成

    先进的化学合成技术将很多疾病治疗方法由理论变为现实.一种新的化合物的合成不仅能够为一种疾病带来有效的治疗方法,还有可能推动对疾病机理或生理过程的研究.优秀的科研团队可以凭借尖端高效的化学合成技术,占得 ...

  7. 2023年第十五届华中杯赛题B 题 小学数学应用题相似性度量及难度评估

    B 题 小学数学应用题相似性度量及难度评估 某 MOOC 在线教育平台希望能够进行个性化教学,实现用户自主学习.在用户学习 时,系统从题库中随机抽取若干道与例题同步的随堂测试题,记录.分析学生的学习和 ...

  8. 2023年华中杯数学建模B题小学数学应用题相似性度量及难度评估解题全过程文档及程序

    2023年华中杯数学建模 B题 小学数学应用题相似性度量及难度评估 原题再现   某 MOOC 在线教育平台希望能够进行个性化教学,实现用户自主学习.在用户学习时,系统从题库中随机抽取若干道与例题同步 ...

  9. 计算机辅助药物筛选教程,药物筛选之计算机辅助药物设计

    欢迎您注册蒲公英 您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册 x 计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)是近年来发展起来的研究与开发新药的一种崭新 ...

最新文章

  1. python 元组和字典的返回值后面有个L是什么意思
  2. vs为什么打了断点不断_为什么西餐厅里的牛排又嫩又多汁?原来大厨都做了“这一步”...
  3. C/C++中ASCII与Unicode字符串相互转换
  4. CDH中文文档下载,Cloudera中文手册,CM中文文档
  5. javascript总for of和for in的区别?
  6. raspberry pi_Linux Foundation安全徽章,Raspberry Pi成功,白宫工具等
  7. 小议size_t和size_type
  8. Sharding-JDBC水平分表(分片策略)_Sharding-Sphere,Sharding-JDBC分布式_分库分表工作笔记008
  9. ToB销售的成交,需要客户对供应商有三个信任
  10. 变压器符号_变压器规格型号有哪些?这篇文章看完全都了解了
  11. 用Html5制作的一款数学教学程序Function Graphics(绘制函数图的程序)
  12. Android 资源(resource)学习小结
  13. UIWebView 无缝切换到 WKWebView
  14. 计算机机械和设计专业介绍,机械类包括哪些专业
  15. 十套精美个人博客网站模板
  16. 哪位有没有reportbuilder的教程?共享一下。万分感谢!
  17. 五千字聊一聊接口测试
  18. unity中的一个简单易用的A*寻路算法类
  19. jquery简单赋值取值
  20. webERP开源系统安装配置

热门文章

  1. 赢在中国 - 史玉柱经典语录
  2. 选择scrum任务看板管理工具的要点
  3. 【万字长文】吃透负载均衡
  4. JVM调优,面到了阿里性能优化师!
  5. 【高并发】又一个朋友面试栽在了Thread类的stop()方法和interrupt()方法上!
  6. 高并发之——创建线程池居然有这么多方式...
  7. 2019年的面试经验:Java程序员越来越悲催了!
  8. 推荐15个高质量学习网站,仅看一眼,就收获满满,赶紧收藏!
  9. 推荐7款超良心的windows软件,每一个都是精品!
  10. bat 重启资源管理器