植物在和病原菌长期斗争过程中,进化出了高效复杂的免疫系统。位于细胞膜表面的模式识别受体 (pattern recognition receptors, PRRs) 在感知病原菌存在、激活免疫反应的过程中发挥重要作用。几丁质 (chitin) 是真菌细胞壁的重要组分之一,病原菌在侵染寄主过程中释放的几丁质寡糖或作为PAMP (Pathogen-associated molecular patterns) 被膜受体CERK (receptor chitin elicitor receptor kinase ) 识别诱发免疫反应【1,2】。多项研究表明,在气传真菌中 (例如稻瘟菌、灰霉菌) 都通过外泌含有LysM结构域的一类效应子帮助病原菌逃避几丁质诱发的免疫反应,然而在土传病原中这类蛋白并没有起到相似的作用【3-5】。土传病原真菌相对于气传真菌有着更广泛的寄主范围,它们如何成功逃避几丁质诱发的寄主免疫反应的分子机制目前尚不清楚。

10月21日,中国科学院微生物所郭惠珊研究员团队在Nature Plants发表了一篇题为Deacetylation of chitin oligomers increases virulence in soil-borne fungal pathogens 的研究论文,揭示了土传维管束病原真菌逃避几丁质寡糖诱发免疫的分子机制。土传维管束真菌可分泌具有高效酶活性的几丁质脱乙酰酶,通过对几丁质寡糖进行修饰逃避寄主的免疫识别,进而抑制免疫反应。

该研究发现,一个聚多糖脱乙酰酶基因(VdPDA1)的缺失严重影响了大丽轮枝菌的致病性,VdPDA1在大丽轮枝菌侵染早期被快速诱导表达,并且该蛋白在大丽轮枝菌和寄主的互作界面的菌丝颈环处大量积累并外泌到寄主质外体空间。体外生化实验表明,VdPDA1在碱性环境中(PH=8)对可溶性几丁质寡糖具有很强的几丁质脱乙酰酶活性。进一步研究发现,脱乙酰后的几丁质寡糖由于不能诱发CERK的二聚化,阻止了免疫信号在胞内的传递,进而抑制了寄主的免疫反应,双遗传试验也进一步验证了上述结果。更有意思的是,该研究将5714个不同来源的真菌聚多糖脱乙酰酶家族蛋白进行聚类分析,发现与VdPDA1聚在一支的主要是土传病原真菌的一类VdPDA1-like蛋白,随后的生化和遗传学试验也进一步证明,这类VdPDA1-like蛋白也具有和VdPDA1类似的生化和生物学功能。

图:乙酰基团(acetyl)在几丁质寡糖被膜受体识别诱发免疫反应中起关键作用;VdPDA1去乙酰化抑制了几丁质寡糖诱导的膜受体的二聚化,从而抑制诱导免疫反应。

综上所述,该研究证明了土传病原真菌利用外泌几丁质脱乙酰酶对可溶性的几丁质进行去乙酰化修饰,使其丧失免疫活性从而逃避寄主的免疫识别。研究结果为深入理解土传病原菌的致病机制奠定了基础。

该工作由中国科学院微生物研究所郭惠珊研究员团队,中国科学院遗传与发育研究所周俭民研究员,中科院微生物研究所张杰研究员合作完成。郭惠珊课题组博士后高峰和博士研究生张博森为该论文的共同第一作者,郭惠珊研究员为通讯作者。研究得到了中国科学院战略性先导项目和国家自然科学基金的资助。

郭惠珊课题组主要研究方向为:1. 植物RNA沉默的分子机制及其抗病应用研究;2. 植物与真菌的互作机理及维管束真菌病害的防控策略研究。以通讯作者先后在Nature Plants, Molecular Plant, eLife, The Plant Cell, PLoS Pathogens, New Phytologist 等国际主流期刊发表文章50余篇。

参考文献:

1. Liu, T. et al. Chitin-induced dimerization activates a plant immune receptor. Science 336, 1160–1164 (2012).

2.  Geoghegan, I., Steinberg, G. & Gurr, S. The role of the fungal cell wall in the infection of plants. Trends Microbiol. 25, 957–967 (2017).

3. de Jonge, R. et al. Conserved fungal LysM effector Ecp6 prevents chitin triggered immunity in plants. Science 329, 953–955 (2010).

4. Takahara, H. et al. Colletotrichum higginsianum extracellular LysM proteins play dual roles in appressorial function and suppression of chitin-triggered plant immunity. New Phytologist 211, 1323–1337 (2016).

5. Kombrink, A. et al. Verticillium dahliae LysM effectors differentially contribute to virulence on plant hosts. Mol. Plant Pathol. 18, 596–608 (2017).

专家点评

董莎萌  教授(南京农业大学 )

真菌细胞壁的主要成分-几丁质是维持细胞结构的必要成分,但几丁质寡糖同时也是一种病菌分子模式,能被植物和动物免疫系统识别引发先天免疫。先前研究发现植物主要利用具有LysM 结构域的植物膜受体识别来源于病菌的几丁质寡糖进而激活免疫反应,而真菌为了逃避植物免疫系统的识别进化出了多种逃逸机制。其中最主要的一种机制是病菌通过分泌具有LysM 类效应子,如番茄叶霉菌的Ecp6、稻瘟菌的Slp1,竞争性结合几丁质寡糖,阻断几丁质被植物识别的机率。但这也意味着真菌必须分泌足够多数量的效应子来结合体表的几丁质寡糖,同时一部分病原真菌并不含有LysM类效应子,那么自然界中是否还存在着其他重要的免疫逃逸机制呢? 

中国科学院微生物所郭惠珊研究员课题组在Nature Plants发表的最新研究结果很好地回答了以上问题。该研究从大丽轮枝菌和尖孢镰刀菌两种土传维管束真菌中鉴定到一种具有寡糖去乙酰酶活性的效应子PDA1,从生化、遗传等角度令人信服地证明了病原真菌“饰以释甲”-通过对自身几丁质进行去乙酰化修饰,使其变为没有植物免疫诱导活性的chitosan,从而揭示了一种病原菌逃逸植物免疫识别的全新而普遍的机制。特别值得注意的是,本研究中发现了轮枝菌与镰刀菌通过PAD1类去乙酰化效应子将几丁质进行隐蔽,这种对几丁质进行酶活修饰的策略相比于叶部侵染真菌依靠效应子分子数量对几丁质进行结合阻断的策略很可能具有更高的免疫抑制效率。该研究也引出了很有趣的问题:PDA1在侵染中是否还有其他的酶活底物?该效应子是如何进化出来的?而植物是否也进化出抑制或者干扰PDA1的免疫机制?

随着农业耕作制度的变化,镰刀菌、轮枝菌等真菌造成的土传病害已成为现代农业生产中的突出问题,防治土传病害的难点在于很多土传病害缺乏天然植物抗性资源,土壤消毒使用大量农药造成环境的严重破坏。郭惠珊研究员的这一最新成果不仅在揭示土传真菌独特致病机制上具有重要理论价值,其发现的PDA1类效应子也是一个潜在的控制土传真菌病害的分子靶标,为作物土传病害的绿色、高效防控提供了一条令人兴奋的线索。

论文链接:

www.nature.com/articles/s41477-019-0527-4

猜你喜欢

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能:提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

在线工具:16S预测培养基 生信绘图

科研经验:云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”

专家点评Nature Plants | 中科院微生物所郭惠珊研究组揭示土传病原菌逃避寄主免疫的新机制...相关推荐

  1. 中科院微生物所郭惠珊团队创建抗土传真菌黄萎病的陆地棉种质

    来源:中科院微生物所 小"小RNA"照亮前行路 作物土传真菌病害每年给世界农业产业造成上百亿美元的经济损失,严重威胁农业产业安全.由于受到土传病原真菌生境特殊.寄主范围广泛以及缺乏 ...

  2. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.5)

    文章目录 征稿.转载.合作 文章分类导航目录 精选文章推荐 会议.招聘广告 科研经验 软件流程 扩增子分析 扩增子教程 QIIME2教程(2020.2) 易生信-扩增子教程 Webserver在线分析 ...

  3. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2023.01)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

  4. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.02)

    宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创立"宏基因组"公众号,联合海内外同行共同 ...

  5. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2022.12)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

  6. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2023.3)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

  7. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2023.7)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

  8. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2023.4)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

  9. 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2023.5)

    欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们! 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创 ...

最新文章

  1. opencv使用cvFindContours提取联通域
  2. Isight 命令行运行任务
  3. 在markdown里面插入特殊的符号
  4. python 调用c++ 回调函数
  5. Axure RP pro 6.5 密钥
  6. 国内芯片60个细分领域重要代表企业【收藏】
  7. 点云nurbs曲面重建c++代码_【科普】抢先收藏!点云数据处理技术概要
  8. android shape 使用小结
  9. 信息学竞赛中的直觉与证明 - 刘汝佳
  10. 开始写博客---越来越笨的脑子
  11. Sails.js简介
  12. 前端开发常用PhotoShop快捷键整理(更新中)
  13. 生成树协议(RTP、RSTP、MSTP)
  14. Linux工具篇 | Ubuntu安装string命令
  15. bind mysql web_bind智能DNS + bindUI管理系统(mysql + bind dlz)
  16. 塞班java手机qq浏览器下载_手机QQ浏览器 for Symbian S60v3
  17. Kubernetes中配置livenessProbe、readinessProbe和startupProbe
  18. 电脑右下角的WiFi图标不见如何处理
  19. abaqus 批量提取不同积分点的数据
  20. 水利RTU遥测终端机厂家

热门文章

  1. 支付宝应用的架构到底有多牛?
  2. 马云自嘲只会用电脑收发邮件,网友:马老师的话,听听就行了
  3. 简单了解SQL性能优化工具MySql Explain
  4. byte[] 和string的转换
  5. table row设置cell的html,display:table、display:table-row和display:table-cell的用法_html/css_WEB-ITnose...
  6. 寻找两个正序数组的中位数——冒泡排序(归并排序)
  7. 综述|寻找自动驾驶中的关键场景
  8. ICRA 2021| 具有在线校准功能的高效多传感器辅助惯性导航系统
  9. 重磅直播|计算深度分割技术的实现与全局效应下的结构光三维重建
  10. 独家 | 以国家战略科学家身份,顶级AI学者朱松纯回国,筹建北京通用AI研究院...