常用生物信息学数据库简介
常用生物信息学数据库简介
- 1、常用数据库
- NCBI(美国国家生物数据库)
- EnsemBI(欧洲生物数据库)
- Uniprot(蛋白质数据库)
- 2、[在线工具galaxy](https://usegalaxy.org/)
- 3、文献检索工具
- PUBMED生物医学文献数据库
- [HighWire Press全球最大提供免费全文的学术文献出版商](http://highwire.stanford.edu/)
- [ISI Web of Knowledge可以找到某一领域引用文献数量最多的综述](http://wokinfo.com/)
1、常用数据库
NCBI(美国国家生物数据库)
EnsemBI(欧洲生物数据库)
相比NCBI的优势:可以查找基因的所有转录本序列,可以查找基因所有可变剪切体的数据
Uniprot(蛋白质数据库)
整合了Swiss-Prot、TrEMBL、PIR-PSD三大数据库的数据,包含了大量蛋白质的生物功能信息和蛋白质序列信息
2、在线工具galaxy
集成很多工具,只要上传数据就可以利用在线工具完成本需使用Linux完成的数据处理,也可以做测序数据的分析
3、文献检索工具
PUBMED生物医学文献数据库
HighWire Press全球最大提供免费全文的学术文献出版商
ISI Web of Knowledge可以找到某一领域引用文献数量最多的综述
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