今天给大家介绍一个数据库:UniProKB数据库(网址http://www.uniprot.org)。这个数据库对于查询蛋白质相关信息还是很全面的。

比如我们想要查询人类p53蛋白的主要功能、结构域、翻译后的修饰和参与的代谢途径,以及与它相互作用的蛋白和疾病这些信息,打开这个网站,输入p53,点击查询。

网页左侧会显示出这个蛋白最常见的物种,我们选择物种是human的p53。

接下来,你会看到网页左侧的导航栏里,有很多你想要查到的蛋白讯息。

这里跟大家稍微介绍一下,我们经常会看到的GO分析,它到底指的是什么?GO分析的全称是Gene Ontology,它包括基因参与的生物过程,所处的细胞位置,发挥的分子功能三方面的信息,通过DAG(有向无环图)的结构表达不同的功能概念,从而较全面地概括了基因的功能信息,简单的说来,我们可以把它理解成基因的族谱和档案。

PDB数据库,蛋白质结构数据库,全称是protein data bank,主要是显示蛋白质的三级结构。

PROSITE数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式,并能根据这些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族。有的情况下,某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低,但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式,这样就可能通过PROSITE的搜索找到隐含的功能motif,因此是序列分析的有效工具。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等;除了序列模式之外,PROSITE还包括由多序列比对构建的profile,能更敏感地发现序列与profile的相似性。PROSITE的主页上提供各种相关检索服务。(来自百度百科)

进入KEGG数据库,可以查询到目的蛋白相关的所有通路。

html查看蛋白质,怎么查询蛋白质的全部信息-- UniProKB数据库相关推荐

  1. 论文解读:通过可解释的集成深度学习学习蛋白质组范围内蛋白质-蛋白质结合位点的蛋白质语言

    Title:Learning the protein language of proteome-wide protein-protein binding sites via explainable e ...

  2. 从千万级数据查询来聊一聊索引结构和数据库原理

    在日常工作中我们不可避免地会遇到慢SQL问题,比如笔者在之前的公司时会定期收到DBA彪哥发来的Oracle AWR报告,并特别提示我某条sql近阶段执行明显很慢,可能要优化一下等.对于这样的问题通常大 ...

  3. oppo手机工程模式清除数据需要密码_「MIUI玩机技巧27」如何快速查询和清除电池信息...

    作为安卓手机的用户,不知道你现在的手机的电量使用如何?是不是感觉到手机电量掉的很快?现在智能手机耗电量确实很大,在正常时间的情况下,好像都是不到一天就没电了?好一点的情况一天一充,我基本上都是一天充电 ...

  4. 千万级别数据查询优化_从千万级数据查询来聊一聊索引结构和数据库原理

    在日常工作中我们不可避免地会遇到慢SQL问题,比如笔者在之前的公司时会定期收到DBA彪哥发来的Oracle AWR报告,并特别提示我某条sql近阶段执行明显很慢,可能要优化一下等.对于这样的问题通常大 ...

  5. ORACLE数据库查询锁表语句sql脚本,以及删除锁信息脚本(数据库开发ETL、DBA必备)

    ORACLE数据库查询锁表语句sql脚本,以及删除锁信息脚本(数据库开发ETL.DBA必备) 文章目录 ORACLE数据库查询锁表语句sql脚本,以及删除锁信息脚本(数据库开发ETL.DBA必备) 前 ...

  6. 如何通过SQL Server语句查询三个月内的信息代码的教程方法

    如何通过SQL Server语句查询三个月内的信息代码的教程方法 作者:张国军_Suger 开发工具与关键技术:SQL Server 2014.SQL.SQL关键字         由于需求需要我们达 ...

  7. MySQL 查看SQL语句执行阶段和进度信息

    MySQL 查看SQL语句执行阶段和进度信息 测试MySQL版本:5.7.31 根据<MySQL性能优化金字塔法则>做的实验,好书推荐! 我们在创建索引时,经常需要等待执行的SQL一段时间 ...

  8. 全国计算机系统导出名单,墨涩网 - 快速查询导出电脑常用信息——墨涩网

    我们的查询电脑硬件信息或者软件版本信息的时候,一般都是在电脑的"设备管理器"和电脑系统属性里面查看,或者直接用下载安装鲁大师查看,今天介绍一个利用bat文件快速查询导出电脑常用信息 ...

  9. access怎么查询工龄_计算机二级Access数据库查询的功能教程

    计算机二级Access数据库查询的功能教程 引导语:査询是Access数据库的重要对象,以下是百分网小编分享给大家的计算机二级Access数据库查询的功能教程,欢迎阅读! 查询的功能 使用Access ...

最新文章

  1. ENC28j60以太网芯片驱动程序简介
  2. vm linux连接互联网,通过wifi将Hyper-V VM(基于Linux)连接到互联网 - Linux中似乎没有连接到wifi...
  3. qchart画完以后删除_画错了,重新画一幅吧!”这句话对学画画的孩子来说,伤害有多大?...
  4. 面试题之判断栈的入栈和出栈序列的合法性
  5. java 头像 微信群_仿微信群头像九宫格控件 LQRNineGridImageView
  6. MQTT 连接 阿里云物联网十六进制数据分析笔记
  7. RocketMQ_问题_启动报错,修改堆内存大小
  8. group by 分组
  9. snmp trap 如何在浏览器中_SNMP Trap的功能介绍
  10. 今天起改用mac的marsedit写博
  11. 世界各国 MCC 和 MNC 列表
  12. 解决VMware重启IP地址改变的问题
  13. 激光打印机与计算机相连,Hp laserjet1010打印机怎么连接电脑使用?
  14. 5g理论速度_5G手机用4G套餐速度达300M每秒,其原因令人费解,西瓜视频聊科技...
  15. TweenMax学习笔记整理
  16. 拉普拉斯矩阵 拉普拉斯算子 图论
  17. Jenkins 插件开发记录
  18. matlab plotroc 画roc曲线
  19. [通信原理实验]北京邮电大学信息工程专业
  20. 开源一个简单的RTS游戏(Unity)

热门文章

  1. 为什么 MongoDB 索引选择B-树,而 Mysql 选择B+树(精干总结)
  2. type_traits之 析取 合取 否定
  3. 保驾护航政务企业上云,云上安全一马当先
  4. scratch设计跑酷游戏_我如何使用Scratch设计游戏
  5. 提高Java反射速度的方法以及对setAccessable的误解
  6. YouTube上的视频听不懂英文怎么办?
  7. C#语言 Asp.net旅游网站在线旅游信息网站(旅游系统旅游网站)旅游管理系统旅游景区旅游网站
  8. Python:实现jaccard similarity相似度无平方因子数算法(附完整源码)
  9. Named Route index has a default child route. When navigating to this named route to name index
  10. 苹果发布无线充新专利,苹果Find My技术成为近几年苹果的重要创新