一. 什么是GWAS meta analysis?为什么要这样做?

GWAS meta分析就是对许多个GWAS分析做一个整合,比如你已经做了一个关于身高的GWAS,而通过文献调研我们发现有很多针对身高的GWAS,那么我们想要对这些summary statistics做整合,对每个位点的效应做权重的调整,从而更加准确的去反映位点对身高的影响并提高统计效应。

GWAS meta分析的核心内容就是对每个SNP的权重进行调整:

Z=∑i=1mwiZi∑i=1mwi2,wherewi=niZ=\frac{\sum_{i=1}^{m}w_iZ_i}{\sqrt{\sum_{i=1}^{m}w_i^2}}, where\ w_i=\sqrt{n_i}Z=∑i=1m​wi2​​∑i=1m​wi​Zi​​,where wi​=ni​​
nin_ini​即第i个GWAS的人群大小,人群越大那么该GWAS在这个位点上的权重分配也就越大。

二. 分析:

2.1 分析软件

  • METAL,等用到之后再详细说明。

参考:

  • https://www.youtube.com/watch?v=EC0TF-GmyVg

GWAS meta分析相关推荐

  1. 用R进行gwas meta分析,原来如此简单

    欢迎关注"生信修炼手册"! 在生物信息数据分析中,R语言是必备技能,简洁的语法,丰富的生态,美观的可视化,种种优势使得其成为该领域中使用最广泛的编程语言之一.用R进行meta分析当 ...

  2. 做Meta分析的10个原则,建议收藏。

    近年来文献数量显著增加,大量不同主题的Meta分析数量也显著增长.在生物医学领域,Meta分析是多种发表类型中拥有较高被引数的类型.针对Meta分析已经有不少书籍或指南,本文是一篇指导Meta分析的简 ...

  3. 贝叶斯软件genle教程_手把手教你用R的gemtc包对生存数据进行贝叶斯网状Meta分析...

    大家好,本教程将介绍如何使用R的gemtc包对生存数据(HR为效应量)进行贝叶斯网状Meta分析. 前提条件: 需要下载R软件(推荐使用的R版本为3.5.3),以及RStudio(一个R的友好交互界面 ...

  4. 观察性研究的网络Meta分析

    1.前言 随着真实世界研究越来越多,更多的观察性研究为当前临床治疗和决策提供重要的证据,可以补充随机对照试验证据的不足.纳人观察性研究的网络Meta分析可更全面地评估当前的临床治疗方案,为临床决策提供 ...

  5. Meta分析到底该怎么选题?

    现在搞Meta的人越来越多,Meta分析已经越来越难发表了,不管你是为了搞职称,为了毕业,还是纯粹为了发文章,为了应付导师,怎么样才能让自己的Meta让杂志很快的接收发表是个很重要的问题,而在这其中选 ...

  6. 临床医生如何解读Meta分析论文?

    Meta分析是翻译自英文meta-analysis,其中"Meta"一词源于古希腊文,意指将事物综合起来观察. Meta分析的概念最早由Light和Smoth于1971年提出,是一 ...

  7. Meta分析如何进行敏感性分析

    Meta分析是临床医生快速发表SCI,医学研究生快速掌握临床科研基本技巧的重要途径.在看已经发表SCI时,大家可能会时不时的看到敏感性分析,或者是sensitive analysis.这个到底是什么? ...

  8. r语言数据变量分段_R数据分析:用R语言做meta分析

    这里以我的一篇meta分析为例,详细描述meta分析的一般步骤,该例子实现的是效应量β的合并 R包:metafor或meta包,第一个例子以metafor包为例. 1.准备数据集 2.异质性检验 in ...

  9. 保留小数点后三位_【Meta分析】Stata制作森林图时,如何保留三位小数?

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...

  10. Meta分析和网状Meta分析速成班( 2019年12月28-29日 上海)

    适合对象 零基础的研究生.临床医务人员.医药院校的科研工作者:迫切希望发表SCI文章晋升的临床工作者.本次速成班特别适合初学者和无基础的学员. 课程背景 本培训班以1篇meta分析和网状meta分析为 ...

最新文章

  1. makefile小技巧
  2. MTK 平台上查询当前使用的摄像头模组及所支持预览分辨率
  3. html实战例子: 课程表
  4. java--xml文件读取(SAX)
  5. 人工神经网络_制作属于自己的人工神经网络
  6. 继承20161223
  7. python基础(十):异常和断言
  8. studio one 3 机架声道设置_「声卡跳线」IXI Mega M8 声卡电脑/手机直播机架跳线(图文教程)...
  9. php 获取当前域名
  10. python的线程池_python线程池 ThreadPoolExecutor 的用法示例
  11. 计算机网络共享文件密码,如何给局域网共享文件夹设置访问密码
  12. 微信如何做好服务器,如何用免费服务器做微信JS开发
  13. java average_Java IntStream average()用法及代码示例
  14. 品味kettle--(一)用eclipse 搭建源码
  15. c语言将一个字符串转置,c语言实现数组的转置
  16. python九宫格拼图_Python制作九宫格图片
  17. 网约车租车平台有哪些,网约车租车平台都有哪些功能
  18. web页面播放优酷视频,播放html5视频,兼容ie7 vcastr22.swf播放
  19. 磁盘调度算法笔记和练习题
  20. 用python分析NBA联盟球员信息,才知道这些秘密!

热门文章

  1. axure键盘弹出_AXURE教程:手机键盘
  2. 安卓天气查询预报APP软件的制作
  3. ET工业大脑将大规模落地江苏 继续发挥“中国智造1%威力”
  4. C语言题目教室数量编程,北京理工大学网教室C语言编程题库及答案(绝对经典).doc...
  5. css+js显示点阵字体/LED七段数码管字体(模拟)
  6. VB连接ACCESS数据库
  7. 收看IT播吧吉米老师iptables讲座
  8. 【网络课程设计】校园网规划方案
  9. 关于Delphi7中日期函数StrtoDate的正确用法 win7报错
  10. 小红伞杀毒软件(德国的) 完全免费的 FREE