【R语言】敏感度、特异度、准确率检验及置信区间求解
来源
- 包:
stats
- 函数:
prop.test
- 官方文档:https://www.rdocumentation.org/packages/stats/versions/3.6.2/topics/prop.test
- 函数:
- 包:
epiR
- 函数:
epi.tests
- 官方文档:https://www.rdocumentation.org/packages/epiR/versions/1.0-10/topics/epi.tests
- 函数:
目的
- 判断两个模型的敏感度、特异度、准确率是否有显著差异
代码
### 统计学检验 ###
# TP1:模型一的真正例数量
# TN1:模型一的真反例数量
# FP1:模型一的假正例数量
# FN1:模型一的假反例数量
# TP2:模型二的真正例数量
# TN2:模型二的真反例数量
# FP2:模型二的假正例数量
# FN2:模型二的假反例数量x <- c(TN1,TN2); n <- c(TN1+FP1, TN2+FP2) # 特异度
prop.test(x,n, correct = T)$p.valuex <- c(TP1,TP2); n <- c(TP1+FN1, TP2+FN2) # 敏感度
prop.test(x,n, correct = T)$p.valuex <- c(TP1+TN1,TP2+TN2); n <- c(TP1+TN1+FP1+FN1, TP2+TN2+FP2+FN2) # 准确率
prop.test(x,n, correct = T)$p.value### 置信区间求解 ###
dat <- as.table(matrix(c(TP1, FN1, FP1, TN1), nrow = 2, byrow = TRUE))
epi.tests(dat)
参考资料:
- https://journals.plos.org/plosmedicine/article/file?type=supplementary&id=info:doi/10.1371/journal.pmed.1002699.s001
- https://journals.plos.org/plosmedicine/article?id=10.1371/journal.pmed.1002699
- http://vassarstats.net/clin1.html?tdsourcetag=s_pctim_aiomsg
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