geneexp.entrez_id = mapIds(x = org.Mm.eg.db,keys = geneLookup,keytype = "ENSEMBLTRANS",column = "ENTREZID")
#先将小鼠的转录本ID转为小鼠的ENTREZID,若是小鼠SYMBOL转ENTREZID,keytype处改成"SYMBOL",其他同理。
library(annotationTools)
library(biomaRt)
human <- useMart('ensembl',dataset = "hsapiens_gene_ensembl")
mouse <- useMart('ensembl',dataset = "mmusculus_gene_ensembl")
m2h.g <- getLDS(attributes = c("entrezgene_id"),filters = "entrezgene_id",values = geneexp.entrez_id,mart = mouse,attributesL = c("entrezgene_id"),martL = human,uniqueRows = T)

BiomaRt 将小鼠的ENTREZID转化为人类的ENTREZID(同源ENTREZID转换)相关推荐

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