Zotero 5.0 + 坚果云同步盘 + papership 配置教程

最近需要一个文献管理工具，然后网上推荐使用Zotero，于是乎装一下吧。原生的Zotero存储空间只有300M，那么就需要第三方代存文件了，使用坚果云或者百度云，由于目前百度云不太支持这种操作了，只能选择坚果云了。另外，为了在IOS端或者IPAD端阅读文献，你可能还需要一个papership软件。所以，这篇博客记录一下三者联合安装的过程，中间可能会需要遇到一些问题，记录下来填坑指南。

更新2020-04-13 11:50：

我们在第三章的第四小节中然对Location of File位置不进行修改，也就是使用Attach sorted copy of files（原文已经进行修改了）。这样做的原因就是我们发现如果使用自定义的位置，就会在papeship中出现pdf文件打不开的错误。也就是出现第五章的问题二：同步文献的附件PDF在PaperShip打不开错误。如果改成Attach sorted copy of files之后，pdf文件是直接可以读取的，而不需要手动进行修改了。
如果出现了Zotero没有帮我们自动改名字，可以通过下面这个步骤进行更改：右击需要改名字的PDF文件——Manage Attachments——Rename Attachments。或者在标题右侧直接进行修改。

更新2020-06-02 22:13：
如果想要在另一台windows电脑上显示之前的zotero标签等等，只需要在相同的位置创建相同的文件名，然后将 编辑——首选项——高级——文件和文件夹中 数据存储位置的内容进行复制即可，将老的文件完全复制到新电脑上就可以了。这样就可以在新的电脑上继续阅读老电脑上的所有文件了！！

1. 安装Zotero

软件的优点这里就不介绍了，感兴趣的同学可以自己搜一下。这里主要介绍一下软件安装。

首先我们在Zotero|Home上下载：

下载：Zotero 5.0 for Windows和Zotero Connector，因为我们使用Google浏览器，顺便把插件也安装一下。（如果你是火狐浏览器或者其他浏览器需要在 Zotero connector for other browsers自己安装一下）
在Zotero官网注册账号，记住账号密码啥的。
打开Zotero Windows软件，在：编辑——首选项——同步——设置，输入用户名和密码就可以了。

2. 安装坚果云

这里使用坚果云另外一个原因就是支持webDAV功能，该功能一个好处是，在iOS移动端的papership也可以通过webDAV读取资料库，这里我们先按下不表，在后面在慢慢介绍。

在官网下载坚果云
然后在注册一个账号，登录以后，然后点击右上角的账号名称——账户信息——安全选项——第三方应用管理——添加应用密码。应用名称我写的zotero，之后会自己生成一个应用密码。（这里的话有三个信息，分别是服务器地址，账户，密码，这些都要记住，不仅仅需要在Zotero软件中填写，也需要在后面的papership中填写。）
首先我们在Zotero中填写这个WebDAV地址。打开zotero,编辑——首选项——同步——文件同步，使用zotero改成WebDAV，然后复制刚才坚果云内第三方应用管理的服务器地址、账户和密码，密码点击下面zotero对应的”显示“复制即可。全部填入后点击下面”Verify Server“按钮。（这里，需要注意一下，网上在这里是否使用WebDav地址有不同的版本，有些说填写，有些说不填写。这里的话我后面和papership进行联调的时候发现，如果这里不填写WebDAV地址的话，会导致之后再IOS端不能不能查看pdf文件，虽然在本地是可以同步的，但是在IOS端好像不能进行同步，所以这里的话我们还是将这两个文件同步 √号都打起来。）

3. 安装ZotFile工具

ZotFile工具实现pdf文件与题录的拆分管理。

参考Zotero配置坚果云的技巧！和Zotero 5.0使用教程/坚果云同步盘和Zotero的配置过程详解（这里我们对两篇博客进行了融合，各取所长。）

首先进入ZotFile的github主页，将最新版本的zip源码包下载下来，并解压。
进入解压出的文件目录内，将目录内的文件重新打成zip包，并将扩展名zip改为xpi。
进入Zotero插件管理页面，选择从文件安装插件，安装上面的xpi文件，重启Zotero即可。
接下来我们还需要进入插件的管理页面，对Zotfile进行一些设置，工具——zotfile proferences——General Settings，首先将Source Folder for Attaching new Files中的目录设置为浏览器默认的下载文件目录（这里，浏览器的下载文件目录，以gooogle浏览器为例子，你可能需要找到浏览器的默认下载路径，然后改成一致，这一点也是十分重要的。如果不改成一致，后面同步文件起来还是比较麻烦的。）然后我们对Location of File位置也进行修改，使用Custom Location（在Zotero 5.0使用教程/坚果云同步盘和Zotero的配置过程详解中作者使用Attach sorted copy of files，这里我们还是按照这种方法，要不然在papership中就不能阅读pdf了，改动起来也是比较麻烦。

5. 在编辑——首选项——高级——文件和文件夹中。首先设置根目录为上面第四步设置的路径E:\Z - Backup - Zotero（需要保持一致）。然后在数据存储位置改为自定义，更改默认存储位置（减少对C盘的消耗，这个位置是我们pdf所保存的位置，所以我们将默认的C盘改掉）。

6. 设置坚果云同步，也就是在E盘中Z - Backup - Zotero点击右键-》坚果云-》同步，这样就同步好了。（因为我们已经同步好了，所以就没有显示同步这个字眼了。）

4. Zotero和坚果云的使用

一般写到这里，软件算是基本装好了。但是如果不说怎么样，其实也还算是没用的，这里我们就举一个简单的例子来演示一下。

在arxiv-sanity官网我们随便找一篇文章，看到右上角的文件标志了吗，那就是Zotetor和Google浏览器的插件。
右键，save to zotero，然后选择第一个。
点击一下，这个时候就会出现如下界面，我们直接选择一个文件夹保存（这个文件夹创建是在Zotero Windows提前创建的，因为有同步的功能，所以在浏览器插件就会显示了。）
我们在Zotero windows打开就会显示刚刚下载的文件相关信息了。
这个时候还没有下载PDF文件，我们将文件下载下来，注意不要修改文件路径，以免找不到文件。（这个文件位置是我们在第三章的第4步骤说明的文件夹路径，注意一下。）
保存完毕之后返回到软件界面，右击刚才下载的文章，选择Attach New File，刚才下载好的PDF文件就会自动被放在这个目录下，并且zotfile自动启动将文件名改好，整个自动化过程。

然后在文件下面就会生成pdf文件，自动命名好了，很方便。然后我们就可以阅读PDF了。

5. papership使用

这是一个可以在苹果手机上可以看到Zotero的，支持WebDav服务。

5.1 软件安装

参考zotero的云服务与移动应用程序

在苹果系统的程序市场，检索zotero，就可以找到PaperShip。
点击Papership图标，
2.1 启动应用后，点击【Login with Zotero】；
2.2 用ZOTERO账号登录；
2.3 授权ZOTERO API key for Papership，点击【Accept Defaults】
2.4 之后就是Papership从ZOTERO服务器下载各种文献信息。 Papership会提示是否下载所有文件，如果想下载所有文件，特别是论文的附件（例如PDF格式论文全文），点击【Download】，否则点击【Later】，仅下载文献条目信息。

软件大概像这样。

5.2 papership 中WebDav设置

点击上面图片中右上角的齿轮标志，点进去之后zotero file hosting。

输入坚果云上得到的WebDav地址。

问题一：然后验证点击Verify server，这个时候可能会出现验证服务器失败的错误。

解决起来也不难。坚果云 | Papership或Zotero使用webDAV验证服务器不成功怎么办？坚果云官网（这个可以在坚果云客户端上点击右上角的网址就可以了），登录坚果云账号，在zotero文件夹新建空白的lastsync.txt文件，务必注意的是，必须使用坚果云自带的新建文件工具来新建lastsync.txt文件，不能通过手动上传的方式。如下图所示：

问题二：同步文献的附件PDF在PaperShip打不开

也就是我们可以在papership中打开目录信息，但是打不开pdf文件

解决：Zotero+PaperShip的使用及问题大家可以参考这个进行修改，结果证明还是可以的。由于电脑端用了rename Attachments，然后把文件删除，重新用“附加文件副本”在添加一遍即可。虽然这样下了删，然后重建添加副件麻烦了一点，但是也保证papership可以正常看到pdf文件啊。

最后我们终于在手机端看到了pdf文件，感动啊。（PS:如果需要对pdf文件进行手机端修改，可能需要花费68~~暂时用不到了）

6. 参考博客

坚果云 | Papership或Zotero使用webDAV验证服务器不成功怎么办？
Zotero配置坚果云的技巧！
Zotero 5.0使用教程/坚果云同步盘和Zotero的配置过程详解
zotero的云服务与移动应用程序
PaperShip官网
研究僧 - 在 IPAD 上阅读文献并与 Zotero 文献库同步

更新2020-04-14 12:04：
今天发现Zotero太好用了，尤其是在笔记上面，它是可以直接复制图片显示的，感觉太好了。另外，买了一个papership会员，感觉也是很棒的，在papership修改的东西也是可以在电脑端进行显示的。不错不错。

花了一天的时间也算是弄好了，中间几乎要放弃了，但是最后还是看各种博客解决了，真的不容易啊。后面尝试一下在Linux和多台电脑上测试一下，看看能不能同步。后面使用中遇到什么问题，我在更新了。