graphpad 折线图横坐标比例_GraphPad Prism绘制剂量反应曲线

原标题：GraphPad Prism绘制剂量反应曲线

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上图是Sci文献中的dose–response curves (剂量反应曲线)，横坐标是药物GS-Se-SG浓度的对数值，纵坐标是Rrelative cell viability(相对细胞活性,% of control)，从图注中可以知道IC50为5.1 μM。那么什么是IC50呢？

IC50(half maximal inhibitory concentration)是指被测量的拮抗剂的半抑制浓度。它能指示某一药物或者物质(抑制剂)在抑制某些生物程序(或者是包含在此程序中的某些物质，比如酶，细胞受体或是微生物)的半量。在凋亡方面，可以理解为一定浓度的某种药物诱导肿瘤细胞凋亡50%，该浓度称为50%抑制浓度，即凋亡细胞与全部细胞数之比等于50%时所对应的浓度。

IC50值可以用来衡量药物诱导凋亡的能力，即诱导能力越强，该数值越低，当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。接下来我将使用GraphPad Prism5.0(win7，64位系统)绘制剂量反应曲线并计算IC50。

数据格式

A列为拮抗剂的浓度，浓度由小至大(0.625——10 mM)，B-I (5个横排)为该浓度所对应的8个复孔的OD值除以对照组吸光度的平均值，然后转化为百分比。

步骤

Step1

打开GraphPad Prism 5.0，XY,选择Points only，Y输入8(因为数据每个拮抗剂浓度有8个复孔)replicate values in side-by-side subcolumn，Create。

Step2

输入数据；

在Graphs下可以看见此时数据Data1的图形；

Analyze，Transform，ok。

Parameters:Transform，选择Transform X values using X=Log(X)->ok。

Graphs下经过转换数据的图形如下：

Step3

Analyze，XY analyzes，Nonliner regression (cure fit)，ok。

Dose-Response-Inhibition,选择log(inhibitor) vs. Normalized response—Variable slope,ok。

此时Graphs下经过计算得到的图形如下：

进行美化后最终效果如下(注：绘图时选择的Mean and Erroe：SEM，数据比较集中所以看起来像没有Error bar，修改为SD后可以看到Error bar，修改方法见GraphPad 绘制折线图或视频操作中)：

在Data with Results下可以看见……Nonlin fit of Transform of Data1的结果：

在Best-fit values下，在横坐标Log(抑制剂浓度)在0.6041时细胞的活性刚好为50%，故该拮抗剂的半抑制浓度为IC50=4.019 mM

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