python机器学习生物信息学

来自南京大学、厦门大学和南京工业大学的科研人员日前在新一期美国《科学进展》杂志上发表论文说，他们开发出一种“基因剪刀”工具的新型载体，可实现基因编辑可控，在癌症等重大疾病治疗方面具有广阔的应用前景。　　被誉为“基因剪刀”的CRISPR基因编辑技术能精确定位并切断DNA(脱氧核糖核酸)上的基因位点，可以关闭某个基因或引入新的基因片段,从而达到治病目的。但脱靶效应一直是阻碍其应用的关键障碍之一。目前的CRISPR-Cas9技术本身具有脱靶效应，给精准治疗带来挑战，且这种技术主要以病毒为载体，还可能导致细胞癌化。

机器学习和数据分析在生物医药领域有广泛应用，能治疗疾病和延长人类寿命。

欢迎各位同学学习python机器学习生物信息学，链接地址为https://edu.csdn.net/combo/detail/1930

作者Toby：持牌照消费金融模型专家,曾任职国内最大医药数据中心数据，和重庆儿科医院，中科院教授保持慢病数据挖掘项目合作！管理过欧美日中印巴西等国外药典数据库，马丁代尔数据库，FDA溶解度数据库，临床试验数据库，WHO药物预警等数据库。

课程介绍

python机器学习生物信息学系列课程包含《python机器学习-乳腺癌细胞挖掘》，《python机器学习-糖尿病数据挖掘》，《呆瓜半小时入门python数据分析》三门课程，共300集左右，定期更新。

这套微专业课程是互联网上最全，最专业的python机器学习建模教程。

慢病数据挖掘和生物信息学很难？此系列课程带您用python语言挖掘乳腺癌，糖尿病，新冠状病毒cov-2019等数据，量化致病因子！由易到难，带你从菜鸟轻松晋级python机器学习高手。碰到问题还有老师答疑哦 ~

《python机器学习-乳腺癌细胞挖掘》：360度讲解python机器学习挖掘乳腺癌数据流程，附代码和老师答疑，供研究生，博士生论文参考。

《python机器学习-糖尿病数据挖掘》：360度讲解python机器学习挖掘糖尿病数据流程，附代码和老师答疑，供研究生，博士生论文参考。

《呆瓜半小时入门python数据分析》：360度讲解python数据分析，pandas，SQL，matplotlib，附代码和老师答疑

课程背景

我国医疗领域重视疾病治疗，忽略疾病预防和家庭科普教育。通过大量疾病数据挖掘，我发现疾病是可防可控的，例如糖尿病，我们合理控制体重和碳水化合物摄入，就可以显著降低糖尿病患病率。python机器学习生物信息学系列课程意在帮助医疗领域科研人员，医生，提醒广大患者家庭疾病科普教育重要性，减少国家每年上涨医疗防控开支。

课程目录

《python机器学习-乳腺癌细胞挖掘》

章节1我的主页和课前咨询答疑
课时1我的所有教学系列介绍
课时2如何联系作者和访问我的主页
课时3欢迎项目合作
课时4如何下载脚本和原始数据
课时5诚谢大家支持
章节2癌症常识
课时6警钟长鸣！癌症就在你身边
课时7癌症科普介绍
课时8病毒细菌诱发的癌症
课时9祸从口入-致癌食物大揭秘
课时10Python机器学习挖掘癌细胞概述
章节3python编程环境搭建
课时11Anaconda快速入门指南
课时12Anaconda下载安装
课时13Canopy下载和安装
课时14Python非官方扩展包下载地址
课时15python第三方包安装(pip和conda install)
课时16Anaconda Navigator导航器
课时17Anaconda安装不同版本python
课时18jupyter1_为什么使用jupyter notebook
课时19jupyter2_jupyter基本文本编辑操作
课时20如何用jupyter notebook打开指定文件夹内容？
课时21jupyter4_jupyter转换PPT实操
课时22jupyter notebook用matplotlib不显示图片解决方案
课时23conda-forge安装rdkit
章节4python基础知识
课时24为什么学习编程？大多数学校不会告诉你的秘密
课时25python官网
课时26Python文件基本操作
课时27变量_表达式_运算符_值
课时28字符串string
课时29程序基本构架（条件，循环）
课时30数据类型_函数_面向对象编程
课时31python2和3的区别
课时32编程技巧和学习方法
章节5sklearn机器学习基础知识
课时33机器学习数据库介绍
课时34机器学习书籍推荐
课时35Python数据科学常用的包
课时36如何选择算法
课时37sklearn算法速查表
课时38sklearn建模基础代码
课时39python数据科学入门介绍（选修）
章节6获取乳腺癌临床数据
课时40数据获取-乳腺癌细胞临床数据
章节7变量筛选和描述性统计
课时41spss因子分析-解释癌细胞特征
课时42变量筛选1-模型法
课时43变量筛选2-比例法percentile
课时44变量筛选3-方差法
课时45变量筛选4-KBest
课时46好变量/特征比算法更重要（英语-课外阅读）
章节8十大经典机器学习算法-建立乳腺癌细胞分类器
课时47逻辑回归logistic regression
课时48支持向量SVM
课时49KNN最近邻算法
课时50决策树-decision tree
课时51随机森林-random forest
课时52神经网络neural network
课时53xgboost
课时54lightgbm基础讲解
课时55lightGBM脚本实现
课时56catboost基础讲解
课时57catboost脚本实现
课时58常见算法优劣对比
课时59bagging VS boosting
课时60随机森林和boosting算法扩展知识（英文课外阅读）
章节9数据预处理
课时61pandasl数据处理基础知识
课时62哑变量处理-hotcode热编码
课时63imputer-缺失数据处理
课时64scale-数据标准化处理
章节10变量（特征）重要性
课时65逻辑回归和集成树算法变量（特征）重要性概述
课时66随机逻辑回归randomized logistic regression
课时67xgboost特征重要性
课时68catboost特征重要性
课时69lightgbm特征重要性
章节11模型调参
课时70遍历调参法
课时71单个参数网格调参
课时72多参数网格调参
课时73随机网格调参_random size search cv
章节12模型验证
课时74模型验证必要性-市场80%模型存在问题
课时75交叉验证cross validation
课时76混淆矩阵
课时77ROC曲线
课时78PSI（population stability index）模型稳定性
课时79基尼系数GINI index-模型区分能力指标
课时80KS（kolmogorov-smirnoff）-模型区分能力指标
章节13附录
课时81如何运用公开资料学习python（GitHub，kaggle，StackOverflow)
课时82显微镜下癌细胞
课时83python在生物分子学应用（英文课外扩展）
课时84SIR模型预测新冠状病毒2019-nCoV

《python机器学习-糖尿病数据挖掘》

课时1我的所有课程介绍
课时2讲师介绍-二十个医药数据库负责人
课时3糖尿病分类_特征_预防概述
课时4机器学习模型预测糖尿病患者血糖指标
章节2python编程环境搭建
课时5Anaconda快速入门指南
课时6Anaconda下载安装
课时7python第三方包安装(pip和conda install)
章节3糖尿病数据挖掘
课时8建立糖尿病预测线性回归模型（linear regression）
课时9下载糖尿病数据方法(原始数据和清洗后数据)
课时10线性回归和误差
课时11模型验证：均方差和中值绝对误差
课时12多算法比较，模型性能提高2倍
课时13原始数据和处理后数据建模性能对比
课时14糖尿病致病因子量化分析_性别，年龄，血压，BMI指数
课时15变量相关性分析-原来s1和s2血清检测呈现高相关性
课时16长寿之道-这课程是你一生财富
课时17BMI指数python自动化计算脚本
章节4附录
课时18糖尿病中英单词汇总
课时19糖尿病患者更容易感染新冠病毒吗？
课时20最小角度回归预测糖尿病论文LeastAngleRegression

《呆瓜半小时入门python数据分析》

章节1前言
课时1呆瓜半小时入门python数据分析课程介绍
课时2我的所有系列课程介绍
课时3如何联系作者和访问我的主页
课时4欢迎项目合作
章节2python编程环境搭建
课时5python基础免费学习地址
课时6Anaconda下载安装
课时7canopy下载安装
课时8python第三方包安装（pip和conda install）
课时9python非官方包下载地址
课时10为什么使用jupyter notebook及如何安装
课时11jupyter基本文本编辑操作
课时12jupyter notebook打开指定文件夹内容
章节3python编程基础
课时13python官网
课时14Python文件基本操作
课时15变量_表达式_运算符_值
课时16字符串string
课时17列表list
课时18程序的基本构架（条件，循环）
课时19数据类型_函数_面向对象编程
课时20python2和3区别
课时21编程技巧和学习方法
章节4pandas基础概述
课时22pandas对Excel数据操作概述
课时23pandas astype数据类型强制转换
课时24pandas.DataFrame.astype数据类型转换
课时25pandas rename更改字段名
课时26pd.ExcelWriter保存结果到已存在的excel文件中
课时27pd.ExcelWriter(to_excel)保存结果到已存在的excel文件中
章节5pandas 筛选数据
课时28pandas loc筛选连续变量
课时29pandas filter筛选指定变量
课时30pandas sample随机抽样数据
课时31pandas条件筛选数据（单条件或多条件）
章节6pandas链接多个表格数据
课时32concat()函数连接多个dataframe
课时33concat()函数连接多个dataframe
课时34merge函数链接两个表格数据(类似vloopup)
章节7pandas绘图
课时35plot.hist绘制直方图_变量频率分析
章节8pandas空缺值处理
课时36df.fillna填充缺失数据
课时37df.fillna填充缺失数据
课时38dropna删除空缺值
课时39dropna删除空缺值
章节9lendingclub金融现金贷用户数据分析画像实战
课时40描述性统计-知己知彼百战百胜
课时41好坏客户占比严重失衡
课时42不要用相关性分析杀人
课时43变量相关性分析-你不知道的秘密
课时44贷款金额和趋势分析-2018年Q4信贷略有缩紧
课时45产品周期分析-看来lendingclub是短周期借贷平台
课时46用户工龄分析-10年工龄用户最多
课时47年收入分析-很多美国人年薪5万美金左右
课时48住房情况与贷款等级-原来美国大部分都是房奴
课时49贷款人收入水平_贷款等级_收入核实多因子分析
课时50贷款用途-美国金融危机浮出水面
章节10str字符串处理
课时51str.replace替换变量名的字符串
课时52str.replace替换变量名的字符串
章节11lambda匿名函数
课时53lambda1_构建一元一次函数和一元二次函数
课时54lambda2_构建几何平均数和调和平均数函数
课时55lambda3_邮件名文本输入规范
课时56lambda4_sort排序应用
课时57lambda5_filter函数筛选奇数或偶数
课时58lambda6_和map函数实现批处理
课时59lambda7_与if语句连用实现条件判断
课时60lambda8_datetime数据结构连用获取年月日
课时61本章节lambda脚本
课时62map函数_实现批量计算
课时63filter筛选大于平均值的数据
课时64reduce函数实现递归计算
章节12python正则表达式
课时65python正则表达式简介
章节13python json
课时66python解析json数据
章节14sqlite3呆瓜半小时快速入门数据分析
课时67sqlite3和sqlitebrowser-新手半小时快速入门之路
课时68sqlite browser下载
课时69sqlite3创建删除表格和插入数
课时70sqlite3插入多条数据
课时71sqlite3可视化绘图数据
课时72sqlite3更新和删除数
课时73数据分析提升fellow me
章节15SQL语法基础
课时74SQL学习网站介绍_练习脚本下载
课时75SQL语法概述
课时76select取数和随机抽样
课时77select distinct语法_筛选不重复数据
课时78where and or筛选条件
课时79order by排序0
课时80left join on连接两个表格数据
课时81SQL复合语句
课时82select as让代码更简洁
课时83create_drop table创建或删除表格
课时84lateral view json_tuple函数解析json数据
课时85lateral view json_tuple函数解析嵌套json数据
课时86get_json_object获取json的信息
课时87get_json_object穿透嵌套json的信息0
课时88lateralView json_tuple get_json_object三个函数穿透嵌套json
课时89substr截取想要信息
课时90regexp_replace正则解析式函数
课时91sql数据分析经验总结
课时92like pattern缩小取数范围
章节16SQL统计函数
课时93count计数函数
课时94avg()求平均值函数
课时95SQL sum求和函数
课时96group by实现分类统计
课时97SQL max和min求最大值和最小值函数
章节17excel数据分析
课时98vlookup
课时99透视表
课时100excel多条件筛选数据
章节18XML存储数据的常用语言
课时101XML概述
课时102XML树结构
课时103XML元素
课时104XML属性

欢迎访问讲师csdn学院教学主页：https://edu.csdn.net/lecturer/5602，学习更多python实战应用。

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