高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程 - 功能介绍

2024-04-12 06:38:46

在线平台BIC 是 ImageGP的重构升级版，重构于2020年初。该平台采用配置文件快速部署工具、生成结果或结果报告。其绘图和分析基于 R 语言(ImageGP 包, 在早期ImageGP脚本的基础上重新进行了封装， GitHub, Gitee)、Python 语言。

左侧导航目前包括：1. Professional plots in seconds; 2. Data transform and extraction; 3. Bioinformatics analysis; 4. Phylogenetic tree view; 5. Resource.

1.1 功能部分

1.1.1 Professional plots in seconds

目前支持 16 种基本图形，包括热图、箱线图、富集分析泡泡图、柱状图、火山图、PcOA 分析、Venn 图、直方图、线图等。每种图根据复杂度不同，有数目不一的可调节参数，可组合出很多复合图形。

1.1.2 Data transform and extraction

常见数据格式转换，如宽矩阵转长矩阵、长矩阵转宽矩阵、合并矩阵、矩阵膨胀等功能。

1.1.3 Bioinformatics analysis

生物信息分析部分包括常见的分析工具如 WGCNA共表达网络分析、LEfSe 特征物种鉴定、Limma 差异基因/物种分析、多序列比对、FASTA 处理、RNA 翻译、正则匹配和空间关系等工具，更多工具也在不断完善中。

1.1.4 Phylogenetic tree view

这是最近尝试的基于 D3.js 的交互式图系列，目前只有进化树展示和多序列比对展示，后面会陆续更新更多交互式图。

1.1.5 Text and video tutorial

这里包括网站使用帮助、常用教程、经典书籍、网址导航等内容，正在陆续更新中。

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