Nature作图也出错 单细胞UMAP/TSNE图的ggplot做法与修饰
复现Nature文章的图表:
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我们这里主要展示UMAP图的ggplot做法,原文图如下:
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复现效果如下:可以发现,原文中3、15标反了,可能原文作者使用PS添加的,或者cluster编号弄反了,可见nature文章也有粗心大意的错误!
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主要解决的问题有:
1、ggplot绘制单细胞UMAP图,设自定义细胞展示顺序、细胞颜色2、ggplot绘制UMAP图,添加cluster标签
3、ggplot实现UMAP图坐标轴在左下角的问题
4、实现legend圈中显示cluster数字
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