聚类,k-mean方法,基于密度的方法:DBSCAN,孤立点检测——数据分析与R语言 Lecture 10

  • 聚类
  • dist( )函数
  • 各种类与类之间距离计算的方法
  • 动态聚类:K-means方法
    • kmeans( )函数
    • K-means算法的优缺点
    • 基于有代表性的点的技术:K中心聚类法
    • K中心法的实现:PAM
    • cluster包的pam( )函数
  • 基于密度的方法: DBSCAN
    • 若干概念
    • DBSCAN
  • 孤立点检测
    • 统计方法
    • 多元正态分布的离群值
    • 基于邻近度的孤立点检测
    • 基于聚类的孤立点检测

聚类


dist( )函数

x1=c(1,2,3,4,5)
x2=c(3,2,1,4,6)
x3=c(5,3,5,6,2)
x=data.frame(x1,x2,x3)

各种类与类之间距离计算的方法

薛毅书P476
最短距离法
最长距离法
中间距离法
类平均法
重心法
离差平方和法

动态聚类:K-means方法

算法:
1 选择K个点作为初始质心
2 将每个点指派到最近的质心,形成K个簇(聚类)
3 重新计算每个簇的质心
4 重复2-3直至质心不发生变化

kmeans( )函数

K-means算法的优缺点

有效率,而且不容易受初始值选择的影响
不能处理非球形的簇
不能处理不同尺寸,不同密度的簇
离群值可能有较大干扰(因此要先剔除)

基于有代表性的点的技术:K中心聚类法

K中心法的实现:PAM

cluster包的pam( )函数

基于密度的方法: DBSCAN

若干概念

DBSCAN


算法基本思想

DBSCAN算法描述
输入: 包含n个对象的数据库,半径e,最少数目MinPts;
输出:所有生成的簇,达到密度要求。
(1)Repeat
(2)从数据库中抽出一个未处理的点;
(3)IF抽出的点是核心点 THEN 找出所有从该点密度可达的对象,形成一个簇;
(4)ELSE 抽出的点是边缘点(非核心对象),跳出本次循环,寻找下一个点;
(5)UNTIL 所有的点都被处理。
DBSCAN对用户定义的参数很敏感,细微的不同都可能导致差别很大的结果,而参数的选择无规律可循,只能靠经验确定。

孤立点检测

统计方法

多元正态分布的离群值

基于邻近度的孤立点检测

基于聚类的孤立点检测

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