python os.system阻塞_为什么python不再等待os.system完成？

我有以下功能，几个月来一直工作得很好。我还没有更新我的Python版本(除非它是在幕后发生的？)。def Blast(type, protein_sequence, start, end, genomic_sequence):

result = []

M = re.search('M', protein_sequence)

if M:

query = protein_sequence[M.start():]

temp = open("temp.ORF", "w")

print >>temp, '>blasting'

print >>temp, query

temp.close()

cline = blastp(query="'temp.ORF'", db="DB.blast.txt",

evalue=0.01, outfmt=5, out=type + ".BLAST")

os.system(str(cline))

blast_out = open(type + ".BLAST")

string = str(blast_out.read())

DEF = re.search("((E|L)\d)", string)

我收到一个错误，blast_out=open(type+".BLAST")找不到指定的文件。此文件作为os.system调用调用的程序输出的一部分创建。这通常需要大约30秒才能完成。然而，当我试图运行这个程序时，它会立即给出我上面提到的错误。

我以为os.system()应该等待完成？

我应该强迫你等吗？(我不想硬编码等待时间)。

编辑：

我已经在BLAST程序的命令行版本中运行了cline输出。一切看起来都很好。

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