EDTA 最简易安装方法
两步安装EDTA
step1
Download the latest EDTA:
git clone https://github.com/oushujun/EDTA.git
step2
Find the yml file in the folder and run:
conda env create -f EDTA.yml
注意事项
需要有conda ,conda安装参考添加链接描述 我安装的是Anaconda3 安装方法与miniconda是一样的,Anaconda3能够安装的软件更多。
以上方法安装EDTA一般不会报错,有可能会报一下错误:
TEsorter is not found in the TEsorter path ./!
如果出现这种情况就conda install TEsorter
解决。如果使用PBS投递系统投递任务,需要切换到EDTA环境,在shell脚本中添加
source activate EDTA
就可以啦,如图所示:以上图片还给EDTA的使用方法举了个例子,运行的时候 用绝对路径 /EDTA.pl -h 就可以查看使用方法。
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