基于Materials Studio的异质结构建模技巧
Materials Studio是美国Accelrys公司生产的新一代材料计算软件。Materials Visualizer模块提供了搭建分子、晶体及高分子材料结构模型所需要的所有工具,可以操作、观察及分析结构模型,处理图表、表格或文本等形式的数据,并提供软件的基本环境和分析工具以及支持Materials Studio的其他产品,是Materials Studio产品系列的核心模块。本文将讲解异质结建模的一些技巧。
首先,导入石墨烯的结构。在ms自带的结构数据库中有一个可以使用的金属Au结构。然后按照同样的方法导入第二个结构,在这里以金属Ag为例。
接着,我们通过Lattice Parameters工具分别查看两个基本结构的晶胞参数:
接下来就是表面的建立。在软件中,我们采用Build—Surface—Cleave Surface工具对晶体结构进行切表面处理。
对于石墨烯,我们首先确定切面,该教程中以(0 0 1)面进行讲解。点击cleave即可得到表面。对于金,我们采用同样的切表面的方式进行切表面处理,又以金是是矩形面,我们只需要设置暴露晶面即可。我们通过Lattice Parameters工具分别查看两个基本表面的晶胞参数
我们可以看出,Au和Ag的(001)晶面的参数分别是4.0857和4.0783,像差很小(10%),我们可以直接采用Build—Build Layer工具进行异质结结构的搭建。在Dedine Layers 面板选择两个表面,注意此时两个表面结构应该激活。点击Matching面板,我们可以选择以Layer 1,Layer 2或者平均值作为构建的基准。点击Build即可得到组合后的结构。
对于异质结结构,我们还可以通过修改z轴,来对结构添加真空层。使用Lattice Parameters工具,在Advanced面板上,取消keep并在Parmeters面板上设置z轴长度即可。
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