anaconda安装rdkit安装指南
rdkit确实不好装,折腾了好几天之后,也算摸出一点经验,在这分享一下。
官方推荐从conda开始装,所以本文从anaconda的安装开始介绍起,然后介绍如何安装rdkit。
首先,安装anaconda。
anaconda是开源的,但是官方下载很慢,推荐在清华大学镜像站下载。
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/
下载后,windows下直接按照流程打开应用程序安装即可。
安装完成后会在开始菜单中出现如下:
其中的Anaconda Prompt (anaconda3)可以打开,是类似cmd的窗口,输入命令:conda -V
,如果显示出版本号,则安装成功
附常用conda 源命令:
conda config --show channels ##显示目前的源
conda config --remove channels urls ##删除源
conda config --add channels urls ##添加源
=============================================
构建好了anaconda环境后,参考以下命令来安装rdkit
windows下推荐下面第一个官方说明
https://anaconda.org/conda-forge/rdkit
下面第二个官方说明我是用来在linux服务器下创建rdkit的运行环境
https://www.rdkit.org/docs/Install.html
但有稍作修改如下:
##为满足软件所需的python版本要求,所以规定了python版本为2.7,可根据需求改动
##另,-c参数指从conda-forge源安装rdkit,-n参数规定了新创建环境的名称为my-rdkit-env(可自定义)
conda create -c conda-forge -n my-rdkit-env rdkit python=2.7
##等待安装完成后,激活这一环境即可使用rdkit
conda activate my-rdkit-env
(看来有问题还是得先看官方
至此完成anaconda环境的配置和rdkit的安装
就这些,结束!
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