Mac M1系统 miniconda安装、配置conda环境，及在conda环境中安装激活QIIME2

Mac M1系统 miniconda安装、配置conda环境，及在conda环境中安装激活QIIME2

1.适配版本的miniconda软件安装包下载（windows, MAC, LINUX）

Miniconda — Conda documentation

2. 打开终端,进入安装包所在文件夹，使用命令进行安装

#打开下载文件所在文件夹

cd Downloads

#进入文件夹下子文件（文件表述打开简介）

bash Miniconda3-py38_4.10.1-MacOSX-arm64.sh

然后一路回车，后面会有个地方输入 Yes 就行。

3.配置环境

安装完成后重启终端，若前面增加（base）则环境自动配置完成，则可以正常使用。

确认当前conda环境

输入conda info --envs

安装成功，并提示如果想关闭自启动conda base环境，可以使用conda config --set auto_activate_base false关闭。

4.在conda环境中安装QIIME2

官方安装激活代码（选择适配自己系统的版本及QIIME版本，此版本为2022.2版本）Natively installing QIIME 2 — QIIME 2 2022.2.0 documentation

中科院遗传所刘永鑫老师分享安装激活代码（2017版本中文安装过程参考）

https://forum.qiime2.org/t/qiime2-chinese-manual/838

官方网站参考代码

更新conda以减少安装过程中的bug

conda环境中安装、激活QIIME2（这个过程可能需要比较久的时间，大约60min）

conda env create….（如果后面激活不了，这个过程多跑几次，可能是漏下载一些软件以至于无法激活，或者由于国内网络限制无法完整下载，这时需要更新下载的.yml文件中的channels）

channels:

- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/qiime2

- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

- defaults

再基于此文件重新安装

qiime --help

激活后界面（在2022.2版本多次安装不成功后，在qiime2论坛我发现不仅我自己遇到了同样的问题，found conflicts! 具体应该是官方的yml包的问题，因此，选择了2021.11版本安装，最后成功安装）

---20220409，在论坛发表的问题反馈得到了解决，MACOX也可以无障碍更新2022.02版本了，yep!

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