flame-fitting 在ubuntu环境配置

前言：

本文记录的是作者第二次配置环境，第一次踩了好多好多坑，配了很久，没有记录。为了记录配置历程，方便其他人（自己），在成功之后又回去配置了一次，不保证没有上一次配置的隐藏优势

很重要的一点是：这是在ubuntu环境下配置的！windows也配置过，没配成功（血泪史）

python版本：3.8

flame-fitting代码链接：

https://github.com/Rubikplayer/flame-fitting

clone：

git clone https://github.com/Rubikplayer/flame-fitting.git

pip and virtual environment

sudo apt-get install python3-pip python3-venv

create

mkdir <your_home_dir>/.virtualenvs
python3 -m venv <your_home_dir>/.virtualenvs/flame-fitting

<your_home_dir>/.virtualenvs就是虚拟环境文件夹所在的路径

这一步可能会遇到permission denied问题，利用

sudo chmod -R 777 （目录名）

进行解决

参考链接：

https://cloud.tencent.com/developer/article/1721836

做好后文件夹里会出现：（.test_envs=.virtualenvs fitting=flame-fitting）

激活虚拟环境

cd flame-fitting
source <your_home_dir>/.virtualenvs/flame-fitting/bin/activate

查看当前文件夹的绝对路径：

pwd

pip更新

pip install -U pip

但是我没做这步，查看了下我的pip版本是20.0.2

查看pip版本：

pip3 –version

安装requirements.txt

pip install -r requirements.txt

成功后出现

(●'◡'●)

接下来是安装MPI-IS/mesh

网址：

https://github.com/MPI-IS/mesh

MPI-IS/mesh-安装boost

sudo apt-get install libboost-all-dev

查看了下我的版本

dpkg -S /usr/include/boost/version.hpp

接下来readme写的是创建虚拟环境啥的，我就直接用的是flame-fitting创建的那个环境。进入flame-fitting的环境。

MPI-IS/mesh-gcc+g++

sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install g++

这个是看别人的踩坑记录里面写的要安装gcc和g++

参考链接：

https://blog.csdn.net/qq_45751990/article/details/126745713

MPI-IS/mesh-makefile

 BOOST_INCLUDE_DIRS=/path/to/boost/include make all

这个命令是要在mesh的文件夹中进行，就是有makefile的那个

/path/to/boost/include 要换成自己的boost的文件位置，一般是在/usr/include/boost，所以我的命令为

BOOST_INCLUDE_DIRS=/usr/include/boost make all

这样就成功了

注意：这里要看看前面有没有error，我出现过报错：launchpadlib 1.10.13 requires testresources, which is not installed，但是最后依旧写的 successfully的情况（跑代码的时候出现找不到psbody库之后，再次安装的时候才发现）

解决方法：

python3 -m pip install launchpadlib

参考链接：

https://blog.csdn.net/chendongpu/article/details/124495162

配好mesh后，readme里面有一个make test，我并没有跑成功，应该是有啥界面的东西没配置，反正我这里是不影响出结果

(●'◡'●)

Eigen

接下来就是配置eigen

clone

git clone https://gitlab.com/libeigen/eigen.git

进入mesh_distance文件夹

cd sbody/alignment/mesh_distance

这个sbody文件夹是在flame-fitting下的，找到后cd过去就好

改路径

在mesh_distance文件夹下有一个setup.py，其中有一句EIGEN_DIR=’./eigen’,将引号中的路径换成自己的路径，也可以将eigen文件夹复制到当前文件夹下，保证路径对就行。

然后

make

这里可能会报错：

我搜了好几个方法都没用，最后是降低eigen版本好的。

解决方法：

eigen官网

下载之前发布的版本，我用的是3.3.2。然后执行make，我这里出现了很多warning，但是没有像之前一样出很多error了

到这里环境差不多就配好了(ᕑᗢᓫ∗)˒ 接下来就是一些零零碎碎的代码需要了

Generic_model.pkl

这个文件是跑代码需要的，得到后把它放在./models里面

可以获得的链接：

https://blog.csdn.net/flyfish1986/article/details/121921796

找的时候还看到有人在问这个问题：

https://github.com/Zielon/MICA/issues/22

这里有人回答了，说是flame网页也可以下载，具体的看看上面的链接

贴一下flame网站链接：flame 网页

Code error

可以开始跑代码试试了：

我是在终端执行命令

python3.8 fit_scan.py

可能会出现这个问题：

解决方案：

https://www.codeleading.com/article/2293832720/

我是直接复制其中的代码，生成新的pkl文件，将新生成的pkl文件替换掉models文件夹下的flame_static_embedding.pkl，再执行fit_scan.py

这样就已经开始生成了！结果输出到output文件夹里

这里再贴一下我第一次查过的网页：

UserWarning: Setuptools will stop working错误：https://blog.csdn.net/qq_40157728/article/details/105521474

boost手动安装：

boost手动安装

Requirements步骤中Numpy报错：

https://blog.csdn.net/SY_qqq/article/details/128818533

我的numpy版本为1.24.2

完结~撒花(*＞◡❛)

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