STAMP使用中数据上传注意事项


链接(http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMP)]

  1. 下载后安装注意安装路径不能有中文。
  2. 打开软件界面如下:
  3. 准备数据表格,格式十分关键!需准备2个表格,表格1的内容是原始数据,表格2是metadata,作用是“告诉stamp这个软件,表格1的样品分组情况”.
    在这里介绍直接用OTU或其他原始数据改spf格式上传的方法:

表1:excel内容有格式要求(注意第一行的表头编写):**

保存好excel表后直接将文档格式后缀xls改为spf,表1完成。

表2:metadata如下,注意表头为样品在表1中的编号+分组情况。最后保存为文本文件(制表符分隔)txt格式。


stamp界面操作:file-load data-上传数据。


结果示例:

图片来源:Intervening Effects of Total Alkaloidsof Corydalis saxicola Bunting on RatsWith Antibiotic-Induced GutMicrobiota Dysbiosis Based on 16Sr RNA Gene Sequencing andUntargeted Metabolomics Analyses

导出图片结果及数据分析结果:

数据结果导出:

图片结果导出:

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