在R中,代码可以分为如下几个级别:

​首先,是你输入了函数对象名称,你可以直接看到代码的,如要获得函数对象fivenum的代码,就只需要在Console中键入函数对象名称fivenum就可以得到结果,这类函数对象的代码是最容易看到的,也是我们学习的最好的材料了,而R中最大多数的函数对象是以这种方式出现的。

​其次,我们在输入mean这类函数名次的时候,会出现如下结果:function

(x, ...)

​UseMethod("mean")

​这表示函数作者把函数“封”起来了。这个时候我们可以先试一试methods(mean),利用methods函数看看mean这个函数都有哪些类型的,我们得到的结果如下:[1]

mean.data.frame mean.Date mean.default mean.difftime mean.POSIXct

mean.POSIXlt

​其实对此可以有一个简单的理解,虽然不够精确。因为在R中,mean函数可以求得属于不同类型对象的平均值,而不同类型对象平均值的求法还是有一些小小差

异的,比如说求一个向量的平均值和求一个数据框的平均值就有所差异,就要编写多个mean函数,然后“封”起来,以一个统一的mean出现,方便我们使

用。这正好也反映了R有一种类似泛型编程语言的性质。既然我们已经知道mean中还有这么多种类,我们可以输入mean.default试一试就可以得到:function

(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...){if

(!is.numeric(x) && !is.complex(x)

&& !is.logical(x))

{warning("argument is not numeric or logical:

returning

NA")return(as.numeric(NA))}if

(na.rm)x

x[!is.na(x)]trim

trim[1]n

(trim > 0 && n

> 0) {if

(is.complex(x))stop("trimmed means are not defined for

complex data")if (trim >=

0.5)return(stats::median(x, na.rm =

FALSE))lo

1hi

hi)))[lo:hi]n

1}.Internal(mean(x))}

​值得注意的是,在R中,出现有多个同样近似功能的函数封装为一个函数的时候(这时候在函数中多半会出现类似UseMethod函数使用的情

况),我们不妨先输入mean.default试一试。这种形式的函数在R中一般作为默认的函数表示。

​第三,这是一种特殊的情况,在这种情况和第二种的原因有些类似,但并不是完全一致。也许我们大家都很熟悉plot函数了吧,输入函数名plot的时候,我们会得到如下结果:function

(x, y, ...){if (is.null(attr(x, "class"))

&& is.function(x))

{nms

(missing(y))y

(!"from" %in% nms)0else if (!"to" %in%

nms)1else if (!"xlim" %in%

nms)NULL}if ("ylab" %in%

nms)plot.function(x, y, ...)else

plot.function(x, y, ylab =

paste(deparse(substitute(x)),"(x)"),

...)}else

UseMethod("plot")}

​请注意plot函数中也出现了UseMethod这个函数,但是和mean不同的是,前面有相当多的语句用于处理其他一些事情。这个时候,我们也使用methods(plot)来看看,得到如下结果:plot.acf*

plot.data.frame* plot.Date* plot.decomposed.ts*

plot.defaultplot.dendrogram*

plot.density plot.ecdf plot.factor*

plot.formula*plot.hclust*

plot.histogram* plot.HoltWinters* plot.isoreg*

plot.lmplot.medpolish* plot.mlm

plot.POSIXct* plot.POSIXlt*

plot.ppr*plot.prcomp* plot.princomp*

plot.profile.nls* plot.spec

plot.spec.coherencyplot.spec.phase plot.stepfun

plot.stl* plot.table*

plot.tsplot.tskernel*

plot.TukeyHSD

不看不知道,一看吓一跳,还以为我们输入plot的输出就是函数本身,结果也许不是如此。可能有人已经理解了,其实最后的UseMethod函数实在默认的调用plot.default函数,赶快再看看plot.default函数吧,发现它再调用plot.xy函数,再看看plot.xy函数,再plot.xy函数中调用了一个.Internal(plot.xy(xy,

type, pch, lty, col, bg, cex, lwd,

...))函数,也许这就是真正起作用的函数了吧。思路基本上就是如此了,是否这个时候您可以获得一些阅读查找R函数内容的乐趣。

​除了直接输入FUN.default形式外,还可以使用getS3method(FUN,"default")来获得代码。这样就解决了绝大多数函数代码查看的工作了。

​在第二种情况种,我们说了一般可以通过FUN.default获得想要的结果。但是只有称为generic的函数才有这种“特权”。而lm等则没有,不过我们也可以尝试使用methods(lm)来看看结果如何,发现:[1]

lm.fit lm.fit.null lm.influence lm.wfit lm.wfit.null

​Warning

message:function 'lm' appears not to be generic in:

methods(lm)

​出现了警告信息,表示说lm不是泛型函数,但是还是给出了结果lm.fit等,大致上可以看成是和lm相关的系列函数吧。这样子就出现了有趣的局面,比如说既有plot.ts,也有ts.plot。依照第三种情况,我们发现竟然有的函数用星号标识了的,比如plot.stl*等,当我们输入plot.stl,甚至是plot.stl*的时候都会给出

要么找不到这个对象,要么干脆是代码错误的信息。原来凡是用了*标识的函数,都是隐藏起来的函数,我们要看这些函数

的代码,我们该怎么办呢?其实也很容易,使用功能强大的getAnywhere(FUN),看看这个函数的名称,就可以猜想到它的功能估计是很强大的,

Anywhere的内容都可以找到!getAnywhere(plot.stl)的结果如下:A single

object matching 'plot.stl' was foundIt was found in

the following placesregistered S3 method for plot from

namespace statsnamespace:statswith

valuefunction (x, labels = colnames(X), set.pars =

list(mar = c(0,6, 0, 6), oma = c(6, 0, 4, 0), tck =

-0.01, mfrow = c(nplot,1)), main = NULL, range.bars =

TRUE, ..., col.range = "light gray"){sers

ncol(sers)data

ncomp))X

sers)colnames(X)

colnames(sers))nplot

1if (range.bars)mx

min(apply(rx

diff))if (length(set.pars)) {oldpar

as.list(names(set.pars)))on.exit(par(oldpar))do.call("par",

set.pars)}for (i in 1:nplot)

{plot(X[, i], type = if (i <

nplot)"l"else "h", xlab = "", ylab = "",

axes = FALSE, ...)if (range.bars) {dx

par("usr")[1:2])y

i])rect(ux[2] - dx, y + mx/2, ux[2] - 0.4 * dx, y

-mx/2, col = col.range, xpd =

TRUE)}if (i == 1

&&

!is.null(main))title(main, line = 2, outer =

par("oma")[3] > 0)if (i ==

nplot)abline(h =

0)box()right

0axis(2, labels = !right)axis(4, labels =

right)axis(1, labels = i ==

nplot)mtext(labels[i], side = 2,

3)}mtext("time", side = 1, line =

3)invisible()}

​注意到前面有一段解释型的语言,描述了我们要找的这个函数放在了什么地方等等。其实对任意我们可以在R中使用的函数,都可以先试一试getAnywhere,看看都有些什么内容。算是一个比较“霸道”的函数。在上面plot.xy函数中,我们还可以看到.Internal这个函数,类似的也许还可以看到.Primitive、.External、.Call等函数这就和R系统内部工作方式和与外部接口的定义有关了,如果对这些函数有兴趣的话,就要学习组成R系统的源代码了。

​最后,如果真的想阅读组成R系统本身的源代码,在各个CRAN中均有下载。你可以得到组成R系统所需要的材料。其中很多C语言(还有就是F)的源代码,均

是精心挑选过的算法,哪怕就是想学从头到尾编写具体的算法,也是学习的好材料。同时,你可以看到R系统内部是如何构成的,理解了这些对于高效使用R有至关

重要的作用。这个范畴的材料就要着重看一看R-Lang和R-inits了。

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