qPCR实验疑难杂问解答
看了别人文献里的PCR方法,照搬了人家的引物,还是做得每次结果都不一样?不是Ct值出现过晚,就是扩增曲线变化很奇怪,总是操作过程中时不时有这样或者那样的问题,遇到这些问题怎么处理呢?实践出真知,今天给大家汇总一下qPCR常见的疑难解答,看下方详细介绍:
疑问1:Ct值出现过晚(Ct>38)
答:
扩增效率低,反应条件不够优化,降低退火温度,增加镁离子浓度。
反应成分降解或加样量不足
PCR产物过长,一般采用80-150bp.
疑问2:标准曲线线性关系不佳
答:
加样存在误差,是样品浓度不成梯度。
标准品出现降解,避免反复冻融。
引物或者探针设计不佳。
模板中存在抑制物或模板浓度过高。
疑问3:溶解曲线存在多个主峰
答:
引物设计不够优化。
引物浓度不佳,上下游引物浓度比例不一致。
镁离子浓度过高。
模板基因组的污染。
疑问4:同一样品中,其中某一个荧光信号特别强。
答:
试剂配制时反应液没有完全溶化,导致探针量在一管增多。
试剂配制时没有充分混匀致各管中各成分的量不同。
PCR仪热槽被荧光物质污染,需要清除热槽中的污染。
疑问5:扩增曲线有一向上或向下的尖峰?
答:
反应过程中电压不稳定
可能在20个循环左右时,仪器有停下或仪器有开盖,使光线突然增强
如果尖峰向下,可能是由卤素灯老化所致,这时应更换。
疑问6:部分样本扩增效率过低?
答:
提取液残留,一定程度抑制了PCR反应
反应液未严格取量混匀或分装不均匀
试剂失效
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