NCBI上传16S rRNA测序数据

1.登陆NCBI官网

NCBI官网链接

2.选择上传序列类型

上传16S rRNA测序数据，直接选16S rRNA就可以，然后弹出上传数据集的类型，选择SRA

3.注册NCBI账号

选择SRA后，会弹出如下的一些提示信息，直接选择submit即可；

3.1 进入提交信息页面

进入正式提交信息的页面；注意此处的“My submissions”选项，注册完账号后，仍需返回这里

3.2 注册NCBI账号

选择右上角的登陆账号—>选择ORCID登陆/注册（已经申请过账号可以直接登陆，没有申请则需要注册依次填写个人信息，个人信息如实填写就可以）—>注册完，后返回本界面，找到 “My submissions”选择。

4. 提交信息

4.1. 提交者信息完成

根据网页上方显示的顺序，依次填写

带星号为必填选项，填写完毕后直接点击"Continue"进入下一项

4.2. 基因序列信息

根据每个选项的要求如实填写就好(下图分别为中英文展示)

注：发布日期即为自己上传的测序序列公开的时间，一般自上传日期起至三个月即可。

4.3. 项目信息

项目名称可以根据返回的测序文件命名(避免与之后上传命名重复)；项目描述只要写清楚就行(测序区间，样品类型，测序设备等）

4.4.生物样品类型

此处只需要选择生物样品类型即可

活性污泥样品就直接选择“Metagenome or environmental”—>点击“Continue”进入下一步

4.5. 生物样本属性

只需要对标注“*”，“ ** ”的填写即可。
其中"Sample Name"直接填写送样时的样品名称，日期最好一个样品名称配一个日期，之前填写的相同的日期，一直显示存在“Error”。其他选项直接按照下列模板填写即可。

4.6. SRA元数据

这里除“Sample Name”，“Filename”自己填写之外，其余部分直接按照下列模板填写即可。注意：“Filename”命名需要填写上传文件名的全部名称（包括后缀名）。例如：上传文件名为：zzx.fastq,则“Filename”命名也需要写为：zzx.fastq，而不是zzx。
点击提交后显示不成功，可以再修改一下Filename选项，填到“Filename2”，多次点击"Continue",即可进入下一步

4.7. Files提交

选择网页提交—>挨个上传原始数据文件夹中的combined_fq.rar里面单个数据文件（可以一次加入三四个文件，防止断网）—>Autofinish submission。等待数据上传完成。

显示下列界面则表示传输完成，点击"Continue"进入下一步

4.8. Review and Submit

点击“Continue”后出现下列界面。则说明提交成功，等待几天后接收SRA号即可

NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据相关推荐

如何用16s rRNA测序数据计算特定菌种的相对丰度并比较
计算特定菌种的相对丰度并比较的一般步骤如下: 序列数据处理: 对16S rRNA测序数据进行去噪.去除低质量.合并重复和去除污染的步骤. 比对和分类: 使用比对工具将序列数据与参考数据库中的基因组进行 ...
计算机网络知识如何建立数据库,如何将本机的SQL Server数据库上传到网站的数据服务器？...
将本机的SQL数据库上传到网站数据服务器一般步骤为:创建表单.导入数据. 下面以SQL Server2008R2 为基础,具体操作方法如下: 1.打开 SSMS - [SQL Server Manag ...
向NCBI上传16S rDNA数据的操作详解
目录写在前面的话正式进行数据提交前查看到的一些参考信息登录NCBI上传网页查看一些引导信息正式的数据提交过程 Aspera提交工具创建bioproject 创建biosample 编写me ...
MicFunPred——最新16S rRNA扩增子数据功能预测数据库
近年来,基于扩增子测序进行物种的功能预测是研究微生物群落功能的主要方面,目前最常用的软件包括Tax4Fun以及PICRUSt2.关于这两款软件的使用方法详可参见凌波微课|扩增子研究第十六讲:扩增子测序 ...
从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据
从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据 NCBI sra 数据下载用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据,更快更稳定! 用别人的数据,发自己的文章由于大多数杂志在文章发表前 ...
php上传查询excel到mysql_PHP上传Excel文件导入数据到MySQL数据库示例
PHP上传Excel文件导入数据到MySQL数据库示例2020-06-20 00:34:11 最近在做Excel文件导入数据到数据库.网站如果想支持批量插入数据,可以制作一个上传Excel文件,导入里 ...
怎么把项目的数据上传到服务器,怎么把sql数据库上传到云服务器
怎么把sql数据库上传到云服务器内容精选换一换本章介绍如何在管理控制台购买GaussDB(for openGauss)实例,并通过内网使用弹性云服务器连接GaussDB(for openGaus ...
mysql管理数据并上传至云端_怎样将MySQL数据库上传到服务器
首先,需要将本地的数据库导出来,作为一个数据文件,以备稍后上传到服务器用,在本地登陆phpmyadmin控制面板: 登陆成功后,在左侧选择需要操作的数据库: 选择后,页面会自动刷新,然后再在右边点击[ ...
laravel-admin / Dcat admin 上传Excel并导入数据到数据库
准备工作安装maatwebsite/excel composer require maatwebsite/excel laravel-admin 效果图创建按钮 $grid->tools(f ...

NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据