VM虚拟机安装ROOT，GEANT4，Python，jupyter notebook
VM虚拟机安装ROOT，GEANT4，Python，jupyter notebook
- 更换镜像源
- ROOT
- 安装依赖
- 从官网下载预编译包
- 解压到安装目录
- 设置启动终端时自动注入ROOT路径
- vi相关问题
- GEANT4
- 安装依赖等
- 安装过程
- 配置
- 运行
- python
- jupyter
注：
- 近期安装了一款虚拟机，记录一下过程
- 欢迎交流，有误请留言
- 如有侵权请联系删除
虚拟机系统为Ubuntu 20.04.3 LTS
更换镜像源
sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bak
sudo vi /etc/apt/sources.list
#清空文档并粘贴诸如下
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-security main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-security main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-updates main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-updates main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-proposed main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-proposed main restricted universe multiversedeb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ focal-backports main restricted universe multiverse
#也可使用如下命令进行替换
#:%s/archive.ubuntu.com/mirrors.aliyun.com/g#更新源
sudo apt update
sudo apt upgrade
可能会出现报错，如下
E: 仓库 “http://ppa.launchpad.net/fcitx-team/nightly/ubuntu bionic Release” 没有 Release 文件
需要打开软件和更新->其他软件，把含有ppa的链接勾掉即可
参考链接
https://blog.csdn.net/yfxhao123/article/details/110491251
https://blog.csdn.net/weixin_42591529/article/details/104768437
ROOT
安装依赖
#安装依赖
sudo apt-get install dpkg-dev cmake g++ gcc binutils libx11-dev libxpm-dev \
libxft-dev libxext-dev python libssl-devsudo apt-get install gfortran libpcre3-dev \
xlibmesa-glu-dev libglew1.5-dev libftgl-dev \
libmysqlclient-dev libfftw3-dev libcfitsio-dev \
graphviz-dev libavahi-compat-libdnssd-dev \
libldap2-dev python-dev libxml2-dev libkrb5-dev \
libgsl0-dev
从官网下载预编译包
使用预编译更方便，这里选择对应的系统版本
解压到安装目录
这里选用/opt
chmod 777 /opt
#解压后使用如下命令改回
chmod g-w /opt
chmod o-w /opt
设置启动终端时自动注入ROOT路径
#vi 打开~/.bashrc 文末添加如下代码
source [rootbuild路径]/bin/thisroot.sh
#重启终端
root
vi相关问题
如果发现vi 方向键等不能使用，因为ubtuntu预装的是vim tiny版本，我们需要的是vim full版本，可如下操作
sudo apt remove vim-common
sudo apt install vim
参考链接
https://root.cern/releases/release-62406/
GEANT4
安装依赖等
#安装gcc等编译程序
sudo apt-get install build-essential
#根据安装需要的库文件，比如
sudo apt install cmake libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev libxt-dev libxmu-dev libxi-dev zlib1g-dev libgl2ps-dev libexpat1-dev libxerces-c-dev qtbase5-dev vim libseccomp2 -y
安装过程
#/path/to为安装目录
#源文件解压到该目录下，如
cd /path/to
tar -xzf geant4.10.07.p03.tar.gz
ls
geant4.10.07.p03
#建立build目录
mkdir geant4.10.07.p03-build
ls
geant4.10.07.p03 geant4.10.07.p03-build
cd geant4.10.07.p03-build
#配置#第一个目录为指定安装的位置，第二个目录为指定源代码的位置，即为上文安装包解压后的文件夹
#-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON (安装时自动下载数据库)
#-DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON (启用多线程)
cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/GEANT4/geant4.10.07.p03-install -DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON -DGEANT4_USE_QT=ON -DGEANT4_INSTALL_DATA=ON -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /opt/GEANT4/geant4.10.07.p03#下方两个为官方的，安装后未成功运行B1
#第一个目录为指定安装的位置，第二个目录为指定源代码的位置，即为上文安装包解压后的文件夹
#cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/geant4.10.07.p03-install /path/to/geant4.10.07.p03
#安装时自动下载数据库
#cmake -DGEANT4_INSTALL_DATA=ON .
#j为计算机逻辑处理器的数量，这里j取4，数值越大越快
make -jN
make install
配置
#打开~/.bashrc，
$ gedit ~/.bashrc
#在其中加入Geant4的环境变量：
source /opt/GEANT4/geant4.10.07.p03-install/bin/geant4.sh
source /opt/GEANT4/geant4.10.07.p03-install/share/Geant4-10.7.3/geant4make/geant4make.sh
#保存后使用 source ~/.bashrc 命令刷新以应用新的环境变量文件。
source ~/.bashrc
运行
#cp B1目录到桌面并进入B1目录
mkdir bulid
cd build
cmake ..
make
./exampleB1
出现如下界面
参考链接
https://geant4-userdoc.web.cern.ch/UsersGuides/InstallationGuide/html/installguide.html#on-unix-platforms
加配置文件
https://zhuanlan.zhihu.com/p/135917392
python
其实可以不用特意安装，系统自带python2 和python3
#查看当前版本
python --version
#显示如下
Python 2.7.18
#安装依赖等
sudo apt update
sudo apt install build-essential zlib1g-dev libncurses5-dev libgdbm-dev libnss3-dev libssl-dev libreadline-dev libffi-dev libsqlite3-dev wget libbz2-dev
#下载安装包
cd /opt
sudo wget https://www.python.org/ftp/python/3.9.0/Python-3.9.0.tgz
tar xzf Python-3.9.0.tgz
cd Python-3.9.0
sudo ./configure --enable-optimizations
sudo make altinstall
#安装后
python3.9 --version
Python 3.9.0
#将python3版本设为默认
#因为下面没有查找到3.9版本对应的程序，故设3.8为默认
ls /usr/bin/python*
#查看当前默认
python --version
#更改python版本，列出替代版本信息
sudo su
update-alternatives --list python
sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python2.7 1
sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python3.8 2
python --version
#显示3.8版本
#系统自带python版本有两个
python2 --vertsion
#显示Python 2.7.18
python3 --version
#显示Python 3.8.10
#上面安装了更新的Python3.9
python3.9 --version
#显示Python 3.9.0
#上面已经设置为Python3.8为默认，运行则按照如下操作
python #3.8
python3.9 #3.9
参考链接
https://blog.csdn.net/weixin_28796657/article/details/113718077
https://zhuanlan.zhihu.com/p/79445767
jupyter
#更新
sudo apt update
sudo apt upgrade
#安装更新pip3
sudo apt install python3-pip
sudo pip3 install --upgrade pip
#安装notebook
sudo pip3 install notebook#安装完成，运行
jupyter notebook
浏览器弹出如下，因已安装root和python则可以新建两种文件
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