1，论文涉及的几个概念

基本再生数R0定义——一个感染病例平均传染的病例数

NGM （next generation matrix），下一世代矩阵—— 连续世代各组别新的感染人数

2，如何计算R0？

线性化 SEIR 常微分方程中的和感染infected状态相关的子系统

——>线性化反应了一开始一个感染者潜在的感染能力，也就是R0

——>同时我们假定了在这个“一开始”的过程中，易感人群数量恒定

我们用T+Σ来表示线性化的子系统

·T 新的感染

·Σ 感染状态的转移

·然后我们计算-TΣ^-1的主特征值——这个矩阵就是NGM(large domain)

论文里又定义了NGM(large domain) ，这个矩阵维度比NGM小。因为这里只考虑了会导致新的感染、感染会转移到的这些状态

NGM(large domain)中，第i行j个元素表示：每一个i状态的元素，会生成多少个j状态的元素

2.1 计算R0举例

上图是一个SEIR的模型

在初始状态E1=E2=T=R=0,S=N

那么初始状态下 βSI/N=βI

S影响E1、E2

而E1、E2、I封闭

于是我们把E1、E2、I，那么在初始状态下，有：

我们令x=(E1,E2,I)' 那么我们需要将这个线性系统写成x=(T+Σ)x的形式

我们去计算他的最大特征值，就是R0了

生物计算论文笔记1：The construction of next-generationmatrices for compartmentalepidemic models相关推荐

论文笔记：ICLR 2021 Combining Lable Propagation And Simple Models Out-Performs Graph Neural Network
前言: 本文的作者认为对于 GNN 的可解释性不足.基于此,作者在节点分类任务上提出可以通过将忽略图结构的浅层模型与两个利用标签结构中相关性的后处理方法相结合,超越或匹配最先进的 GNN .具体如下: ...
论文笔记目录（ver2.0）
1 时间序列 1.1 时间序列预测论文名称来源主要内容论文笔记:DCRNN (Diffusion Convolutional Recurrent Neural Network: Data-Dr ...
论文阅读笔记——Vulnerability Dataset Construction Methods Applied To Vulnerability Detection A Survey
本论文相关内容论文下载地址--Web Of Science 论文中文翻译--Vulnerability Dataset Construction Methods Applied To Vulnera ...
Hierarchical Graph Network for Multi-hop Question Answering 论文笔记
Hierarchical Graph Network for Multi-hop Question Answering 论文笔记 2020 EMNLP,Microsoft 365, 这篇文章所提出的层 ...
Perceptual Quality Assessment of Smartphone Photography(论文笔记)
Perceptual Quality Assessment of Smartphone Photography(论文笔记) 论文笔记论文地址:Perceptual Quality Assessmen ...
【论文笔记】Learning Synergies between Pushing and Grasping with Self-supervised Deep Reinforcement Learn
文章目录 [论文笔记] Learning Synergies between Pushing and Grasping with Self-supervised Deep Reinforcement ...
ORB-SLAM3 论文笔记
ORB-SLAM3 论文笔记这篇博客 ORB-SLAM3系统相机模型的抽象(Camera Model) 重定位的问题图片矫正的问题视觉惯性SLAM的工作原理相关公式 IMU初始化跟踪和建图 ...
【论文笔记】 LSTM-BASED DEEP LEARNING MODELS FOR NONFACTOID ANSWER SELECTION
一.简介这篇论文由IBM Watson发表在2016 ICLR,目前引用量92.这篇论文的研究主题是answer selection,作者在这篇论文基础上[Applying Deep Learnin ...
最新图神经网络论文笔记汇总（附pdf下载）
点击上方,选择星标或置顶,不定期资源大放送! 阅读大概需要15分钟 Follow小博主,每天更新前沿干货 [导读]近年来,图神经网络变得非常火热,每年顶会在该领域内都会出现大量的研究论文,本文为大家提 ...

生物计算论文笔记1：The construction of next-generationmatrices for compartmentalepidemic models

1，论文涉及的几个概念

2，如何计算R0？

2.1 计算R0举例

生物计算论文笔记1：The construction of next-generationmatrices for compartmentalepidemic models相关推荐

最新文章

热门文章