MEG公开数据集整理
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关键词:MEG、公开数据、资源推荐
本期推文是 Public Neuroscience Dataset 系列主题的第四期内容。这期推文编者整理了3个文献使用最多的MEG公开数据集,以便利大家开展MEG相关研究。
脑磁图(Magnetoencephalography,简称MEG)是一种功能性神经成像技术,它主要通过非常灵敏的磁强计纪录大脑自然放电所产生的磁场,并绘制大脑活动的影像。超导量子干涉仪(superconducting quantum unit interference devices, SQUID)阵列是目前最常见的磁强计。脑磁图被广泛应用于对知觉和大脑认知过程的基础研究,和在手术切除前定位受病理影响的区域,确定脑各部位的功能以及神经回馈。既可以应用于临床上发现异常的位置,也可以应用于实验上简单的脑活动测量。
01 The Open MEG Archive (OMEGA)
OMEGA 数据库由麦吉尔大学麦康奈尔脑成像中心和蒙特利尔大学合作建立。
该数据库由220 名受试者的多模态数据集组成,其中约 300 条静息态 MEG 数据:182 条健康对照,38 条病患(ADHD、慢性疼痛等)。
该数据集有以下特点:
- 目前首个完全专注于 MEG 的开放数据存储库,且所有数据都符合BIDS标准
- 所有数据均可使用开源的EEG/MEG分析工具包Brainstorm 直接读取
- 所有数据同时包含每位受试者的T1结构像
- 所有数据包含每位受试者的匿名人口统计学问卷信息
- 提供收录上传功能,可将自己的数据库开放上传
数据库项目主页:https://www.mcgill.ca/bic/resources/omega
关于该数据库更详细介绍,参考此文献:http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2015.04.028
该数据库采用授权访问机制,申请授权:https://www.mcgill.ca/bic/omega-registration
注:BIDS全称Brain Imaging Data Structure,是一个脑影像数据结构标准,关于BIDS详细介绍,参考此篇文献https://www.nature.com/articles/sdata2018110 。
02 Human Connectome Project (HCP)
HCP(人类连接组)项目由来自明尼苏达大学的Kamil Ugurbil 教授和来自华盛顿大学的David Van Essen 教授牵头建立。HCP 使用大大改进的数据采集、分析和共享方法,为科学界提供了数据和发现,极大地增强了我们对人脑结构、功能和连通性及其与行为关系的理解。
该数据集包含1200名受试者的 3T 及7T MRI数据和MEG数据,所有受试者年龄范围介于22岁至35岁。
数据库项目主页:https://www.humanconnectome.org/study/hcp-young-adult
数据库访问地址:https://www.humanconnectome.org/study/hcp-young-adult/document/1200-subjects-data-release
数据库采用注册访问机制,注册地址:https://db.humanconnectome.org/app/template/Login.vm
03 Cambridge Center for Ageing Neuroscience (CAMCAN)
CAMCAN 是剑桥大学的一个大型合作研究项目,于 2010 年 10 月启动。该项目由生物技术和生物科学研究委员会 (BBSRC) 提供大量初始资金,随后得到来自医学研究委员会 (MRC) 认知与脑科学部门 (CBU) 和欧盟地平线 2020 LifeBrain 项目的支持。
该项目使用流行病学、认知和神经影像学数据来了解个人如何才能最好地将认知能力保留到老年。该数据库包含CAMCAN 项目 I 和 II 阶段的详细数据,其中包括700多例MRI,fMRI和MEG数据,MEG数据使用Elekta Neuromag Vectorview数据采集,共计306通道。详细统计见下图。
数据库项目主页:
https://camcan-archive.mrc-cbu.cam.ac.uk/dataaccess/
关于该数据库更详细介绍,参考此篇文献:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1053811915008150
数据库采用授权获取访问机制,申请授权地址:
https://camcan-archive.mrc-cbu.cam.ac.uk/dataaccess/datarequest.php
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