Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 一文解释了火山图如何解读。不太难看懂,而一旦看懂了,图也就知道怎么绘制了。

BIC无代码绘制差异基因火山图留下一个小问题,如何在图上标记基因?

如何上传文件、选择文件,见上一篇文章BIC无代码绘制差异基因火山图;网站访问链接:进入到火山图绘制页面http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/analysis?page=b%27Nw%3D%3D%27。

如果想在火山图上标记基因,可以通过文本域Sets of genes to be labeled in the plot输入一堆要标记的基因 (可以是一列,也可以是多列,要有标题行)。

设置参数如下,因为提供的基因只有1列,Label column可以不设置。

获得结果

我们的差异基因分析表格中基因的IDENSEMBLE编号,如果想用Gene symbol或其它编号怎么操作?那就输入多列信息。

设置参数如下,注意Label column选择使用Symbol列进行标记。

获得结果

测试数据获取:https://gitee.com/ct5869/bic

点击阅读原文访问网站

往期精品(点击图片直达文字对应教程)

机器学习

后台回复“生信宝典福利第一波”或点击阅读原文获取教程合集

续昨天的文章,在火山图标记基因名字相关推荐

  1. ggplot做火山图---添加任意基因标签|||突出显示标记基因

    火山图系列我们之前已经说过很多做法了(绝美!差异基因火山图大全!),这些作图已经够用了,也是发文级别的.但是最近又看到一种ggplot做火山图的方式,然后增加了一些自己的想法,我想这个会更有意义. 话 ...

  2. 画个火山图,标记下基因的名字

    Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 BIC无代码绘制差异基因火山图 如何上传文件.选择文件,见上一篇文章BIC无代码绘制差异基因火山图 如果想在火山图上标记基因,可以通过文本域Se ...

  3. Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图

    火山图是散点图的一种,它将统计测试中的统计显著性量度(如p value)和变化幅度相结合,从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点(基因等).常应用于转录组研究,也能应用于基 ...

  4. 典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集

    典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化介绍了实验的设计.数据获取.数据标准化和注释,下面是如何利用Limma和线性模型鉴定差异基因,并进行GO富集分析. 线 ...

  5. R 数据可视化 02 | 火山图

    R 数据可视化 02 | 火山图 文章目录 R 数据可视化 02 | 火山图 一. 示例数据准备 二. 环境需求 三. 绘制火山图 1. 火山图 2. 标记基因的火山图 四. 保存为图片 五. 详细参 ...

  6. Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 (在线轻松绘制)

    封面来源于:Pixabay+易生信 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.高颜值在线绘图和分析.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-se ...

  7. Python生物信息学⑥绘制热图及火山图

    Python生物信息学⑥绘制热图及火山图 Python生物信息学③提取差异基因 通过上Python生物信息学③提取差异基因得到了该数据集的差异分析的两个关键参数,1.差异倍数(foldchange)以 ...

  8. 扩增子图表解读5火山图:差异OTU数量及变化规律

    欢迎点击「宏基因组」关注我们!专业干货每日推送! 背景介绍(Introduction) 宏基因组学 宏基因组学目前的主要研究方法包括:微生物培养组学.16S/ITS/18S扩增子.宏基因组.宏转录组. ...

  9. 宏基因组扩增子3统计绘图:中文首发,最详系,零基础(箱线图、散点图、热图、曼哈顿图、火山图、韦恩图、三元图、网络图)

    本网内容首发"宏基因组"公众号,更佳阅读体验.更多相关文章,欢迎点我跳转至公众号阅读 注:文为蓝色字均为文章链接,可点击直达 写在前面 优秀的作品都有三部分曲,如骇客帝国.教父.指 ...

最新文章

  1. MPB:河湖着生硅藻样品采集、永久玻片制作及鉴定
  2. oracle判断一个字符是否是数字
  3. MySQL CHAR、VARCHAR、TEXT、ENUM、SET(字符串类型)
  4. 武汉轻工大学计算机学院操作系统复试题目,2016年武汉轻工大学数学与计算机学院计算机组成原理复试考研复试题库...
  5. 2019可信云云计算开源产业大会:腾讯云TStack获多云管理认证及多项殊荣
  6. Android 应用开发(31)---界面原型设计
  7. D. Little Artem and Dance
  8. resiprocate 之repro注册
  9. 技巧 | Markdown 语法中首行缩进的方法
  10. 清空oracle的注册表,Oracle中清除注册表
  11. 浩辰CAD中如何加载插件?CAD插件安装教程
  12. Wi-Fi 6 BSS着色和空间重用白皮书
  13. wmp流代理服务器设置为空,03服务器安装wmp10的方法
  14. 黑鲨手机出现要启动android,黑鲨手机死机解决办法详细说明
  15. yum 代理(系统代理对 yum 不生效)
  16. 非乘a非b_给你28万 ,你买B+级车还是豪华入门车?
  17. java-php-python-ssm企业人事管理系统计算机毕业设计
  18. bootstrap自学总结不间断更新
  19. 手把手教你用Python打造一款属于你自己的个性二维码
  20. 集成融云 SDK 怎么实现多端同步未读数

热门文章

  1. 作者:冯仕政(1974-),男,中国人民大学社会与人口学院教授、副院长。
  2. 《大数据》第1期——创刊寄语
  3. 【Python】处理UnicodeDecodeError: ‘gbk’ codec can’t decode byte 0xa2 in position…
  4. 又是毕业季I 【O(1)数论】(洛谷P1372题题解,Java语言描述)
  5. 【Java】基于IDE的JUnit软件测试入门
  6. 【数据结构与算法】顺序表的Java实现
  7. 【Java】总结Integer类的API
  8. autotools 自动编译系列简介
  9. react+mobx:如何组织store之最佳实践
  10. Windows 7 HomeGroup的隐私保护