超详细的ROC曲线绘制教程
ROC曲线是临床中常用的统计分析之一,R中可以绘制ROC曲线的包也有很多,pROC
包就是其中的佼佼者。
pROC包可以计算AUC和95%置信区间,可以可视化、平滑和比较ROC曲线。下面是pROC
包中的常用缩写
缩写 | 解释 |
---|---|
ROC曲线 | 受试者操作特征曲线 |
AUC | ROC曲线下面积 |
pAUC | 部分ROC曲线下面积 |
CI | 置信区间 |
SP | 特异度specificity |
SE |
灵敏度sensitivity |
1. 加载数据
使用pROC包自带的aSAH
数据集来演示。该数据集包括了113例动脉瘤蛛网膜下腔出血患者的临床和实验室资料。
library(pROC) # 加载pROC包
data(aSAH) # 加载内置数据集
head(aSAH) # 查看数据集
2. 拟合曲线
在pROC包中,使用roc()来建立ROC对象。默认情况下roc()会输出AUC的值。
roc1 <- roc(aSAH$outcome, aSAH$s100b,
超详细的ROC曲线绘制教程相关推荐
- 超详细的热图绘制教程(5000余字),真正的保姆级教程
生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.高颜值在线绘图和分析.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流 ...
- python 将多个模型的ROC曲线绘制在一张图里(含图例)
一. 多条ROC曲线绘制函数 def multi_models_roc(names, sampling_methods, colors, X_test, y_test, save=True, dpin ...
- 多分类问题的ROC曲线绘制
多分类问题的ROC曲线绘制 目录 多分类问题的ROC曲线绘制 #roc曲线 (1)ROC曲线图中的四个点
- gitkraen_超详细!Github团队协作教程(Gitkraken版)
超详细!Github团队协作教程(Gitkraken版) 一.前期工作 1. 在 Github 上创建 organization step1. 登录Github网站,点击右上角头像,选择 " ...
- 9切换中文mac_超详细的Mac重装系统教程!让重装系统变得简单起来!
mac电脑该怎么重装系统?苹果电脑在长时间使用后,系统可能会变得比较慢,另外各种缓存垃圾也会越堆越多,影响电脑的反应速度.mac OS系统是苹果电脑独有的操作系统,重装mac系统过程和Win系统完全不 ...
- r roc曲线 语言_R语言系列6:生存分析中多重时间依赖性ROC曲线绘制 timeROC
上一篇文章,我们讲到R语言实现Cox回归生存预测模型构建,以及如何将Logistic回归中,多条ROC曲线绘制在一个图里 今天主要围绕生存分析中,预测模型验证部分,如何将多条time-depend e ...
- python详细安装教程-超详细Python与PyCharm安装教程,看这一篇就够了
原标题:超详细Python与PyCharm安装教程,看这一篇就够了 学习了三天的python, 之前测试一直用课程自带的网页版玩玩, 为了学习 然后就下载了一个python和pycharm 现在分享下 ...
- macbook重装系统 选择方案_超详细的mac重装系统教程
最新的macOS系统具有稳定,安全,长时间使用不卡顿等等很多的优点.而Windows电脑重装系统则是非常常见的事情.不过就算再稳定的系统也难免有需要重装的时候.mac重装系统相对来说还是比较简单的,不 ...
- Pycharm汉化,Pycharm怎么改成汉语,手把手教学,超详细(汉语插件安装教程)
pycharm汉化 pycharm怎么改成汉语,手把手教学,超详细(汉语插件安装教程) 首先,打开 pycharm.然后点击左上角File(文件)会弹出如下页面继续点击蓝色位置Settings-(设 ...
最新文章
- PIL 转opencv
- 初识Entity Framework CodeFirst(3)
- VS2008 error PRJ0002 : 错误的结果 31 (从“C:\Program Files\Microsoft SDKs\Windows\v6.0A\bin\rc.exe”返回)。...
- mui.ajax中文乱码
- linux函数入参个数限制,PowerShell函数中限制数组参数个数的例子
- 读取xml文件分析 EntityName 时出错的解决方案
- ios查看帧率的软件_软件测试之性能测试(ios)——获取fps(流畅度)
- 使用超级鹰模拟登录验证码报错的解决办法
- 办公计算机班半学期总结,计算机班的班主任工作总结.docx
- Mysql数据库日期查询
- java 实现短信验证码
- nginx proxy_pass 502 这是什么错误?
- NC57中间表数据源的设置流程
- ubuntu开启键盘背光灯
- 工厂软件支持及测试是什么,软件工厂
- 从 HTTP 瞎逼逼到 HTTP/2
- 安装zsh并修改配置
- socket常用参数解释
- 导弹追踪飞机c语言编程,防御导弹 (C语言代码)
- Python各类库的简介(转)