分子系统学-多序列比对和系统进化分析教程

分子系统学-多序列比对和系统进化分析

003-1 MAFFT多序列比对教程-本地版
003-2 MAFFT多序列比对教程-在线版
003-3 序列格式转换工具-推荐使用
003-4 Jmodeltest模型计算方法与说明

004-1 多基因序列快速联合（拼接）与格式转换-软件SequenceMatrix
004-2 多基因序列快速联合（拼接）详细版-SequenceMatrix
004-3 贝叶斯多基因片段联合分区建树（分区设定模型）

005-1 MEGA置根-修改树图标尺-显示分枝长度-自举值显示方式等设置
005-2 利用Figtree软件编辑设置MEGA树图
005-3 如何编辑贝叶斯或PAUP（ML）树图（PDF格式）的名称、字体、分枝等
005-4 树图美化-拓扑结构添加背景色填充彩色标注等
005-5 Figtree软件美化树图-全面说明（推介使用）
005-6 TreeView X软件查看美化树图教程

006-1 iq-tree模型计算教程（可以处理大数据）
006-2 iqtree构建ML树和具体参数说明
006-3 iq-tree建树结果查看与节点值显示

007-1 不同建树方法的优缺点比较
007-2 如何选择进化树的外类群序列
007-3 DNA序列的保守区计算与导出

008-1 Barcoding gap分析 K2P遗传距离SpeciesIdentifier-TaxonDNA
008-2 DAMBE序列碱基替换饱和性检验

009-1 DNAman多序列比对位点图（DNA序列一致性计算）
009-2 DNAman多序列比对位点图（氨基酸序列一致性计算）
009-3 DNAman测序结果序列拼接

010-1 同质性检验准备-多基因序列快速联合（拼接）-SequenceMatrix
010-2 PAUP多序列同质性检验（检验多序列是否适合联合分析）

011-1 Bioedit多序列比对与输出
011-2 多序列比对结果导出与美化（推介）结果示例文件：http://blog.sina.com.cn/s/blog_14a5cc6420102yb40.html
011-3 DNA和蛋白序列作图美化教程
011-4 多序列比对美化标注教程

012-1 RaxML网页在线构建最大似然树及其结果查看和设置
013-1 ProtTest模型计算软件安装说明-Windows系统
013-2 ProtTest模型计算软件使用方法-氨基酸模型计算

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