R语言安装及包的使用

1、进入R语言官网https://cran.r-project.org/

2、选择相应的系统的R语言下载,我的电脑为windows系统。如果提示选择下载源的话,尽量选择自己的国家的距离自己所在地点近的源,以便提高下载速度。

3、选择自己想要的版本,推荐base版本,因为版本比较稳定,基本上能用大部分的包,基本没有不兼容的情况。

4、点击[Download R-4.2.1 for Windows]下载安装包

5、下载完成后点击安装包进行R语言的安装,注意:路径尽量不要出现中文,而且安装的地方尽量不要放在C盘,以及记住自己的安装路径。

6、R语言安装包的地点主要有三个:CRDN、bioconductor、Github,CRDN的包的安装:install.packages(‘package_name’)

7、bioconductor的包的安装需要先下载bioconductor,进入其官网http://bioconductor.org/,点击安装[Install]。

8、直接复制代码框的指令,然后在R语言的命令台运行。

9、随后安装成功后即可使用,安装指令BiocManager::install(‘package_name’)。

10、Github的包需要去Github官网搜索,进入相应的项目后会提示安装方法,部分需要手动安装。Github官网:https://github.com

11、代码:

#显示包的路径
.libPaths()#安装某个包
#install.packages(package_name)#安装Bioconductor,官网最新的安装指令
BiocManager::install('biocLite')
'
if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.15")
'#以前使用的指令
#source('http://bioconductor.org/biocLite.R')#下载ALL数据包
BiocManager::install('ALL')#生成等差序列1~10
seq(1:10)#绘制箱线图,显示上下界、上下四等分线、中位线
boxplot(seq(1:10))
boxplot(seq(1:10))

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