常用的文献管理软件有：Endnote、Biblioscape和Reference Manager。由于不知道哪个好用，我把三个都装上进行了对比。

一、首先是在Word中引用文献功能的比较。
Endnote是最方便的，工具条上的按键就可以把文献插入到Word中。Biblioscape也能与Word集成，但不够方便，要先把文献都引用好之后，再进行一个类似扫描的操作才能生成尾注。Reference Manager似乎不行，最早被我淘汰掉，所以后面的比较都没有Reference Manager了。
需要强调的是，Word自身也提供插入引用的功能，但是这个功能太弱智，居然多次引用同一篇文章会编多个号。EndNote发现引用文献相同就直接使用同一个编号。

二、然后是文献管理的方便性
主要包括几个方面的内容：
2.1 建立目录：要管理的文献不上千也上百了，建立目录分门别类才好。这方面Endnote不行，只能新建文件(Library)，没有分目录的功能。Biblioscape支持目录功能。
2.2 搜索：EndNote和Biblioscape区别不大，都支持题目、作者、关键字等搜索功能。
2.3 排序：没想到EndNote在这么简单的功能上栽了跟头。按照年份排序是对的，按照Title排序居然是乱的。
2.4 连接文件：EndNote和Biblioscape都具备把一个文献条目链接一个文件的功能。这样在浏览文献时就可以方便地打开全文了。
2.5 查找相同：EndNote和Biblioscape都具有查找相同文献的功能。
2.6 交叉引用：也就是一篇文献引用另一篇文献。EndNote不支持交叉引用关系。Biblioscape很好，可以在文献之间建立很多关系：引用、同作者等。

三、导入导出的兼容性
一个文献，有作者、题目、关键字、摘要、刊名、刊号、页码等等那么多信息，逐个输入谁受得了？当然要自动导入了。Elserver的格式可以导入EndNote和Biblioscape。但最方便的是IEEE导入EndNote，一点就自动打开Endnote了。而可气的是EndNote和Biblioscape居然不能互相导入（难道是我太笨搞不定？）。最后我居然是把EndNote一篇一篇导出才能导入Biblioscape！
中文的网站似乎都不支持。中国期刊网其它方面都不错，就这方面显得落后。

四、其它功能
与Endnote相比，Biblioscape似乎是专业的，它不仅有看都看不过来的各种条目，甚至有个Web Server可以把文献目录在网上发布，还能在Web上维护文献目录。一个实验室维护一个文献目录多方便啊，师弟们想找某方面的文献上Web就行了，连前人的评论和注释都有。

起初，我为了Endnote不支持目录管理而耿耿于怀，选择了使用Biblioscape。我把Endnote里的文献一个个导入进去。在Web上美滋滋地浏览着我管理的文献。但是我每次上IEEE搜几篇文章下来都要吭哧吭哧得导入一通，把我烦坏了。最终，我选择了Endnote管理我的文献，我把文献分成不同的类别，建立了十几个Library文件。虽然它的功能不是最强，但是它正好能最方便地满足我的要求。

最后声明一下，我用的是：
Endnote 7＋中文补丁
Biblioscape 6
Reference Manager 10