解决Anaconda环境下使用rpy2提示“unable to determine r library path: command……”
博主的Anaconda安装在E盘,新建了一个虚拟环境(Research),新建这个环境时同时安装了Python和R,没有单独安装R语言。
在JupyterLab中运行如下代码:
import rpy2
正常运行,说明rpy2包已经正常安装导入。然后运行如下代码:
import rpy2.robjects as rb
开始报错:
Unable to determine R library path: Command '('E:\Anaconda\envs\Research\Lib\R\bin\Rscript', '-e', 'cat(Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH"))')' returned non-zero exit status 1.
在网上找了很多的方法,都无法解决,后来终于找到了一个方法:
找到“E:\Anaconda\envs\Research\Lib\site-packages\rpy2\rinterface_lib\openrlib.py”这个文件,将26-28行注释掉,这3行的代码如下:
LD_LIBRARY_PATH = (rpy2.situation.r_ld_library_path_from_subprocess(R_HOME)if R_HOME is not Noneelse '')
参考资料
Unable to determine R library path – Python (tutorialink.com)
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