GO和KEGG富集分析是我们在筛选出差异表达基因之后，都会去做的套路性分析。然鹅……我相信，总有那么一些“倒霉孩子”会遇到跟我一样的窘境吧，好不容易筛选出来的差异基因，尝试了DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)、Metascape(https://metascape.org/)、g：Profiler(https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/)等之后，仍然富集不出来通路，这真是个令人悲伤的故事嘞~

就在我万念俱灰的时候，我神奇的发现了一个网站，居然富集到了好几条通路哦，心情顿时开朗许多~~

现在，就把这个最强大的基因富集分析在线工具分享给大家啦~揭开它神秘面纱的时候到了，它就是——KOBAS！！！

KOBAS(KEGG Orthology Based Annotation System)，网址：http://kobas.cbi.pku.edu.cn，是由北京大学魏文丽课题组开发的数据库，主要功能是用于基因/蛋白质功能注释和功能富集。随着数据量不断增加，KOBAS至今为止共经历了3次升级，除了1.0版本的KEGG代谢通路之外，2.0版本增加了PID Curated，PID BioCarta，PID Reactome，BioCyc，Reactome和Panther等数据库，除此之外还增加了疾病的查询，使得KOBAS的功能更加强大。而3.0版本更是增加了lncRNA的鉴定、注释以及富集功能，还建立GSEA，GSA和 PADOG等功能。

KOBAS的功能最主要分为两个部分，Annotate(注释)和Enrichment(富集)。

接下来我们就以“Annotate”为例来体验看看如何利用KOBAS做GO和KEGG的富集分析吧！

点击“Annotate”选项，进入注释界面。

“Species”为物种，可根据自己测序组织来源进行选择，如人，大鼠，小鼠等。

“Input Type”为输入格式/类型，支持如图Fasta Protein Sequence，Gene Symbol等七种格式，可根据自己的输入数据进行选择。

输入数据后，点击“Run”进行提交，等待数秒即可出结果。

得到注释结果，如下图所示，点击“Detail”可查看基因注释的Pathway通路、疾病及GO功能分类。注释结果下方还提供链接进行结果下载哦。

点击第二列“KEGG Gene ID”可以直接链接到KEGG数据库查看具体信息。

点击第三列“Disease”中“Detail”注释结果如下所示，可具体了解与差异表达基因相关的疾病信息哦~

“Gene-list Enrichment”部分，“Input Type”， “Species”及“Input”与注释时基本一致。

“Datebase”中可选择自己感兴趣的数据库进行分析。

“Advance Options”中可自行选择参数，包括背景基因、统计学方法及校正方法等。

与“Annotate”一样，设置好所有参数后，点击“Run”，等待数秒即可得到分析结果哦，且结果都可进行下载，方便又快捷。

此外，KOBAS除在线使用外，还可将下载到本地，具体可点击官网菜单栏“Download”进行详细了解哦，在此不做详细介绍啦。

总之，KOBAS不仅仅可以得到GO和KEGG富集分析结果，还可以了解与之相关的疾病信息。学习了这么多，赶紧把你手中筛选到的差异基因操作分析起来吧，说不定马上就会得到意想不到的结果哦~~

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