多位点序列分型_多位点序列分型(MLST)及其应用.pdf
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DOh10.3784~.issn.1003-9961.2008.10.020 · 综 述 ·
多位点序列分型及其应用
张少敏(综述),徐建 国(指导)
摘要: 多位点序列分型(muhilocussequencetyping,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方
法。这种方法通过PCR扩增多个管家基因内部片段并测定其序列,分析菌株的变异。MLST操作简
单,结果能快速得到并且便于不同实验室的比较,已经用于多种细菌的流行病学监测和进化研究。
随着测序速度的加快和成本的降低,以及分析软件的发展,MLST逐渐成为细菌的常规分型方法。
关键词: 管家基因;多位点序列分型;应用
中图分类号:R34 文献标识码:A 文章编号:1003—9961(2008)10—0648—03
Multilocussequencetyping and its application ZHANG Shao—min,XU Jian—guo.Institute of
Communicable Disease Controland Prevention,Chinese CenterforDisease Controland Prevention,
Beijing102206,China
Correspondingauthor:ZHANG Shao—min,Email:zhang—shaomin@163.corn
Abstract: Muhilocussequencetyping (MLST)wasproposedasanucleotidesequence—basedapproach
thatcouldbeappliedtomanybacterialpathogens.Itanalyzedallelicvariationatmultiplehousekeeping
locibynucleotide sequencingofinternalfragments.MLST combined developmentsinhigh—throughput
sequencingand bioinformaticswith established population geneticstechniquesto provide aportable,
reproducible,and scalable typing system thatreflected the population and evolutionary biology of
bacterialpathogens.
Keywords: housekeepinggene;muhilocussequencetyping;apply
多位点序列分型 (muhilocussequencetyping, 酸序列信息 。因为这种基于核苷酸序列测定的方法
MLST)是一种通过直接测定多个管家基因的核苷酸 可以准确地记录细菌基因水平上的变异,并且核酸序
序列来发现细菌变异的分型方法。它由Maiden等Ⅲ 列可以通过互联网方便地传递,所以MLST被用于研
于 1998年首次运用于脑膜炎奈瑟菌的分型,后来由 究细菌的流行病学、群体生物学、致病生『和进化_11。
于其结果精确并且易于传递而广泛应用于其他致病
1 MLST方案设计
菌、真菌以及一些非致病菌。MLST由多位点酶电泳
(muhilocusenzy
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