CentOS7 安装cellranger-4.0.0
下载:
wget -O cellranger-4.0.0.tar.gz “https://cf.10xgenomics.com/releases/cell-exp/cellranger-4.0.0.tar.gz?Expires=1603204594&Policy=eyJTdGF0ZW1lbnQiOlt7IlJlc291cmNlIjoiaHR0cHM6Ly9jZi4xMHhnZW5vbWljcy5jb20vcmVsZWFzZXMvY2VsbC1leHAvY2VsbHJhbmdlci00LjAuMC50YXIuZ3oiLCJDb25kaXRpb24iOnsiRGF0ZUxlc3NUaGFuIjp7IkFXUzpFcG9jaFRpbWUiOjE2MDMyMDQ1OTR9fX1dfQ__&Signature=JiTRZ58sv9SZxoKfdkdfB3LSj8PmvbTh-yKWmNYeM70oDeVeSgOOKxwSAoeGK3672evLTo0Aqdm8brf-kEifKnBJxBlFUmbXGk0qafBYdCGoDp7UYYhULwvxFaJGqmaDq5FDDrKjPYW0t5wZ5mF-LAJTkzb5Re4HlyJZsjS5Q7NhiEnJ4Cn1f9Qtgu7ecdQ24WnhB2IAZP650ZLYLK8qu-c56JB9cDJ4ZgxeZ9HjK6DAlIb97S-Isko6tyPT02IXlg6QIzfcZTHX-A9xYfhBT09IsQH4wPjoaoj27zAKKh5A8Co3iiPxelmC8fecK37hqjeCe0Wb6hfeeqfh8Q__&Key-Pair-Id=APKAI7S6A5RYOXBWRPDA”
解压:
tar -xzvf cellranger-4.0.0.tar
环境变量:
生效时间:新开终端生效,或者手动source /etc/profile生效
生效期限:永久有效
生效范围:对所有用户有效
Linux环境变量配置方法六:vim /etc/environment
该方法是修改系统环境配置文件,需要管理员权限或者对该文件的写入权限:
如果/etc/bashrc文件不可编辑,需要修改为可编辑
chmod -v u+w /etc/environment
vim /etc/profile
按“I”,然后贴上下面内容:
在最后一行加上
export PATH=$PATH:/home/cellranger/cellranger-4.0.0/bin
按ESC,输入:wq回车退出。
修改完记得执行行下面的命令,让上一步的修改生效:
source ~/.bash_profile
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