这里写自定义目录标题

一、安装linux Centos 7.9
二、配置固定IP
- 1、修改ip
- 1、关闭SElinux
三、安装torque
- 1、下载torque
- 2、更新库
- 3、安装
测试
鸣谢
如有侵权，请留言我

一、安装linux Centos 7.9

教程太多了，例如：https://blog.csdn.net/u013168176/article/details/81144193

我用的U盘安装

青椒，没有钱，3.8W买了服务器作为VASP计算服务器, 选取《development and Creative workstation》简单勾选compatibility lib, Platform Development and Python.

先连上网，然后复制下边代码，改为阿里云源,以备后用。

[********]wget -O /etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo http://mirrors.aliyun.com/repo/Centos-7.repo
[********]yum makecache

二、配置固定IP

查看现有ip，单位设置动态IP 静态IP不好申请，在动态IP后半段设置为固定IP

1、修改ip

[*******]# ifconfig  #查看现有IP
em1: flags=4163<UP,BROADCAST,RUNNING,MULTICAST>  mtu 1500inet 10.10.73.XX  netmask 255.XXX.XXX.0  broadcast 10.10.XXX.XXXinet6 fe80::b2f5:e5d6:d29d:6a08  prefixlen 64  scopeid 0x20<link>ether XX:XX:6d:XX:XX:XX  txqueuelen 1000  (Ethernet)RX packets 10637021  bytes 5364344539 (4.9 GiB)RX errors 0  dropped 2  overruns 0  frame 0TX packets 1773134  bytes 364816699 (347.9 MiB)TX errors 0  dropped 0 overruns 0  carrier 0  collisions 0device interrupt 16  memory 0x92f00000-92f20000
[*******]# vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-em1   #按照以下设置
TYPE=Ethernet
PROXY_METHOD=none
BROWSER_ONLY=no
BOOTPROTO=static
DEFROUTE=yes
IPV4_FAILURE_FATAL=no
IPV6INIT=yes
IPV6_AUTOCONF=yes
IPV6_DEFROUTE=yes
IPV6_FAILURE_FATAL=no
IPV6_ADDR_GEN_MODE=stable-privacy
NAME=eth0
UUID=1d72f9ca-dac1-4398-a093-6b001edd94d6 #原本机器的
DEVICE=eth0
HWADDR=00:15:5d:01:fb:0c #需要修改
ONBOOT=yes
IPADDR=10.10.XXX.XXX   #ip
NETMASK=255.XXX.XXX.0
GATEWAY=10.10.XX.XX
DNS1=210.XX.XXX.XXX
DNS2=114.114.114.114

然后重启网络服务
下面展示一些 内联代码片。

[*******]# service network restart
Restarting network (via systemctl):                        [  OK  ]

1、关闭SElinux

[*******]# vi /etc/selinux/config # This file controls the state of SELinux on the system.
# SELINUX= can take one of these three values:
#     enforcing - SELinux security policy is enforced.
#     permissive - SELinux prints warnings instead of enforcing.
#     disabled - No SELinux policy is loaded.
SELINUX=disabled
# SELINUXTYPE= can take one of three values:
#     targeted - Targeted processes are protected,
#     minimum - Modification of targeted policy. Only selected processes are protected.
#     mls - Multi Level Security protection.
SELINUXTYPE=targeted[*******]# setenforce 0[*******]# systemctl disable firewalld.service #关闭
Removed symlink /etc/systemd/system/multi-user.target.wants/firewalld.service.
Removed symlink /etc/systemd/system/dbus-org.fedoraproject.FirewallD1.service.
[*******]# systemctl stop firewalld.service
[*******]# reboot

三、安装torque

1、下载torque

[*******]$ wget http://wpfilebase.s3.amazonaws.com/torque/torque-6.1.2.tar.gz

2、更新库

[********]yum install libtool openssl-devel libxml2-devel boost-devel gcc gcc-c++

3、安装

[*******]# ./configure --enable-gcc-warnings --enable-syslog --with-scpmake -j 8 # 最多允许8个编译命令同时执行

更改hosts network

[********]vi /etc/hosts127.0.0.1   localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4
::1 localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4
10.10.72.59 marain #新加入[********]vi /etc/sysconfig/network
NETWORKING=yes
HOSTNAME=marain

查看主机名一致性

[*******]# hostname -s
marain
[*******]# hostname -f
marain

安装

[********]make install

成功后查看

[*******]# cat /var/spool/torque/server_name
marain

拷贝并启动trqauthd

[*******] cp contrib/systemd/trqauthd.service /usr/lib/systemd/system/[*******]systemctl enable trqauthd.service #有效化
[*******]systemctl start trqauthd.service[*******]systemctl status trqauthd.service #查看

root安装

[*******]# ./torque.setup root
initializing TORQUE (admin: root)You have selected to start pbs_server in create mode.
If the server database exists it will be overwritten.
do you wish to continue y/(n)?y
[*******]#

核数设置

[*******]vi /var/spool/torque/server_priv/nodesmarain np=48退出后重启trqauthd[********]qterm[********]systemctl start trqauthd.service[********]for i in pbs_server pbs_sched pbs_mom trqauthd; do service $i start; done[********] pbsnodes
marainstate = freepower_state = Runningnp = 48ntype = clusterstatus = opsys=linux,uname=Linux marain 3.10.0-1127.19.1.el7.x86_64 #1 SMP Tue Aug 25 17:23:54 UTC 2020 x86_64,nsessions=0,nusers=0,idletime=2717,totmem=98297820kb,availmem=96801524kb,physmem=65529824kb,ncpus=96,loadave=0.03,gres=,netload=5784240,state=free,varattr= ,cpuclock=Fixed,macaddr=04:d9:f5:50:e9:bc,version=6.1.2,rectime=1604502030,jobs=mom_service_port = 15002mom_manager_port = 15003

打包

make packages

运行mom

[********] ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --installInstalling TORQUE archive... Done.
[********]  ldconfig
[********]  systemctl enable pbs_mom.service  #dir:/usr/lib/systemd/system/pbs_mom.service
[********]  systemctl start pbs_mom.service

配置队列

[********]# qmgr -c 'p s'
#
# Create queues and set their attributes.
#
#
# Create and define queue batch
#
create queue batch
set queue batch queue_type = Execution
set queue batch resources_default.walltime = 01:00:00
set queue batch resources_default.nodes = 1
set queue batch enabled = True
set queue batch started = True
#
# Set server attributes.
#
set server scheduling = True
set server acl_hosts = marain
set server managers = root@marain
set server operators = root@marain
set server default_queue = batch
set server log_events = 2047
set server mail_from = adm
set server node_check_rate = 150
set server tcp_timeout = 300
set server job_stat_rate = 300
set server poll_jobs = True
set server down_on_error = True
set server mom_job_sync = True
set server keep_completed = 300
set server next_job_number = 0
set server moab_array_compatible = True

安装结束，队列名字为:batch

测试

写一个测试脚本sleep.sh, 内容如下

#!/bin/sh
sleep 60

提交作业

[********]qsub sleep.sh

检查作业

[********] qstat -a  -n

此时可以看到作业的运行状态。

鸣谢

1、sob大神及其名下思想家公社、计算化学公社等等等…… 我的启蒙恩师
2、https://www.bilibili.com/video/BV1d4411r7WF?t=565 abbottcn大神的完整版视频，我给命令整理了下，并部分改动
3、https://blog.csdn.net/kongxx/article/details/8022496# 测试脚本出处

如有侵权，请留言我

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