聚类效果评价——Calinski-Harabasz(CH指标)——内部评估标准(2)
Caliński, Tadeusz, and Jerzy Harabasz. “A dendrite method for cluster analysis.” Communications in Statistics-theory and Methods 3.1 (1974): 1-27.
公式与简介
CH指标的计算公式是:s=tr(Bk)tr(Wk)×nE−kk−1s = \frac{\mathrm{tr}(B_k)}{\mathrm{tr}(W_k)} \times \frac{n_E - k}{k - 1}s=tr(Wk)tr(Bk)×k−1nE−k
其中BkB_{k}Bk 为 between-clusters dispersion mean(类间距离),WkW_{k}Wk为 within-cluster dispersion(类内部的距离),详细公式如下:
Wk=∑q=1k∑x∈Cq(x−cq)(x−cq)TW_k = \sum_{q=1}^k \sum_{x \in C_q} (x - c_q) (x - c_q)^TWk=∑q=1k∑x∈Cq(x−cq)(x−cq)T
Bk=∑q=1knq(cq−cE)(cq−cE)TB_k = \sum_{q=1}^k n_q (c_q - c_E) (c_q - c_E)^TBk=∑q=1knq(cq−cE)(cq−cE)T
WkW_{k}Wk 中:CqC_qCq表示当前点所在的类qqq;cqc_qcq是当前类qqq的聚类中心点
BkB_{k}Bk 中:CeC_eCe表示类eee的中心;nqn_qnq表示类别qqq包含的点数。
值越大表示聚类效果越好
代码实现
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn import metrics
from sklearn.cluster import KMeansdataframe = pd.DataFrame(data=np.random.randint(0, 50, size=(200, 10)))
# 以kmeans聚类方法为例
kmeans_model = KMeans(n_clusters=3, random_state=1).fit(dataframe)
labels = kmeans_model.labels_
score = metrics.calinski_harabasz_score(dataframe, labels)
print(score)
参考文章
sklearn:https://scikit-learn.org/stable/modules/clustering.html#calinski-harabasz-index
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