lammps教程：create_box 命令详解

lammps模拟时所有的原子都必须位于一个有限的区域内，这个有限的区域也就是所谓的模拟盒子：box。
因此，在创建原子之前，要先创建box，用到的命令为create_box。
create_box的语法为：

create_box N region-ID keyword value

其中,N为盒子内包含的原子个数，region-ID为区域名称。
1. 创建正交box
创建一个模拟盒子之前必须先创建一个区域，在此区域的基础上创建盒子。
例如创建一个大小为101010的立方区域，名称为mybox。以mybox尺寸创建box，box内含有1种原子。

region mybox block 0 10 0 10 0 10 units box
create_box 1 mybox

如果region为球形，lammps首先计算出一个外切于此球的立方区域，应以此创建box，而不是创建一个球形的box。
例如：

region box sphere 0.0 0.0 0.0 5  units box
create_box 1 box

以上命令创建的盒子大小为101010。
2. 创建非正交box
如果region区域为非正交区域，则以此区域可以创建非正交box。

region box prism 0 10 0 10 0 10 2 0 0
create_box 1 box

3. 创建复杂box
如果box内原子之间有键或角等信息，需要在创建box时指定键角等数量，具体格式为：

bond/types value = # of bond types
angle/types value = # of angle types
dihedral/types value = # of dihedral types
improper/types value = # of improper types
extra/bond/per/atom value = # of bonds per atom
extra/angle/per/atom value = # of angles per atom
extra/dihedral/per/atom value = # of dihedrals per atom
extra/improper/per/atom value = # of impropers per atom
extra/special/per/atom value = # of special neighbors per atom

例如创建含有H2O分子的box：

region box block 0 10 0 10 0 10 units box
create_box 2 box bond/types 1 angle/types 1 extra/bond/per/atom 2 &extra/special/per/atom 2 extra/angle/per/atom 1

create_box命令应该是相对简单的一个命令，但要记住每个模型只有一个box，create_box用一次就足够了。

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