经常运行一些生物信息软件的时候，提示：Could not find/open font when opening font “arial”, using internalnon-scalable font等信息。此时，表示CentOS系统缺乏相应的字体文件。需要安装，步骤如下：
1.widonws下载字体文件到Linux
windows的字体比较多，其字体文件位于 C:\WINDOWS\Fonts。从其中copy相应的字体到Linux系统的 /usr/share/font/下的文件夹中。以arial字体为例：
# mkdir/usr/share/fonts/arial
# cp arial*.ttf/usr/share/fonts/arial/
2. 为刚加入的字体设置缓存使之有效
# cd/usr/share/font/arial
# mkfontscale
# mkfontdir
# fc-cache -fv
经过这样的设置后，即可在Gnome界面的系统——首选项——外观——字体中进行字体的选择了。
3. 设置gunplot对arial的选择路径
本文首页提示的错误是由于程序调用gunplot造成，必须让gunplot识别arial字体所在的路径才行。
$ exportGDFONTPATH=/usr/share/fonts/arial
$ exportGNUPLOT_DEFAULT_GDFONT="arial"

gnuplot画图技巧

安装git
yum -y install zlib-devel openssl-devel perl cpio expat-devel gettext-devel
yum install git

下载opentsdb2.0.0源码
//git clone git://github.com/stumbleupon/opentsdb.git

https://github.com/OpenTSDB/opentsdb/releases/tag/v2.0.0RC1
cd opentsdb
./build.sh

执行过程报错，错误信息如下
Can't exec "aclocal": No such file or directory at/usr/share/autoconf/Autom4te/FileUtils.pm line 326.

网上搜了一下，发现缺少automake工具
yum install automake
安装完antomake后进入opentsdb目录再次执行
./build.sh

3.设置&运行
先启动hadoop和hbase集群
配置环境变量，在shell中执行如下命令：
env COMPRESSION=none HBASE_HOME=/usr/hadoop/bbase0941

./opentsdb/src/create_table.sh
在hbase伪分布环境下貌似要修改create_table.sh,否则建表会卡住：

exec"$hbh/bin/hbase" shell <<EOF
create'$UID_TABLE','id', 'name'
# {NAME => 'id', COMPRESSION =>'$COMPRESSION', BLOOMFILTER => '$BLOOMFILTER'},
# {NAME => 'name', COMPRESSION =>'$COMPRESSION', BLOOMFILTER => '$BLOOMFILTER'}

create'$TSDB_TABLE','t'
# {NAME => 't', VERSIONS => 1,COMPRESSION => '$COMPRESSION', BLOOMFILTER => '$BLOOMFILTER'}

create'$TREE_TABLE','t'
# {NAME => 't', VERSIONS => 1,COMPRESSION => '$COMPRESSION', BLOOMFILTER => '$BLOOMFILTER'}

create'$META_TABLE','name'
# {NAME => 'name', COMPRESSION =>'$COMPRESSION', BLOOMFILTER => '$BLOOMFILTER'}

启动tsd服务

./build/tsdb tsd --port=4242--staticroot=build/staticroot --cachedir=/tmp/tsdtmp –zkquorum=localhost

tsd服务运行参数说明：
Usage: tsd --port=PORT --staticroot=PATH --cachedir=PATH
Starts the TSD, the Time Series Daemon
  --async-io=true|false Use async NIO (default true) or traditionalblocking io
  --auto-metric        Automatically add metrics to tsdb as they are inserted.  Warning:this may cause unexpected metrics to be tracked
  --cachedir=PATH       Directory underwhich to cache result of requests.
  --flush-interval=MSEC Maximum time for which a new data point canbe buffered (default: 1000).
  --port=NUM            TCPport to listen on.
  --staticroot=PATH     Web root from which toserve static files (/s URLs).
  --table=TABLE         Nameof the HBase table where to store the time series (default: tsdb).
  --uidtable=TABLE      Name of theHBase table to use for Unique IDs (default: tsdb-uid).
  --worker-threads=NUM  Number for async io workers(default: cpu * 2).
  --zkbasedir=PATH      Path underwhich is the znode for the -ROOT- region (default: /hbase).
  --zkquorum=SPEC       Specificationof the ZooKeeper quorum to use (default: localhost).

以下是tsdb可运行的命令
usage: tsdb <command> [args]
Valid commands: fsck, import, mkmetric, query, tsd, scan, uid

4.测试

保存标签

./build/tsdb mkmetric proc.loadavg.1mproc.loadavg.5m

编写脚本并运行
cat >loadavg-collector.sh <<\EOF
#!/bin/bash
set -e
while true; do
  awk -v now=`date +%s` -v host=`hostname` \
  '{ print "put proc.loadavg.1m " now " " $1" host=" host;
     print "put proc.loadavg.5m " now "" $2 " host=" host }' /proc/loadavg
  sleep 15
done | nc -w 30 192.168.145.1294242
EOF
chmod +x loadavg-collector.sh
nohup ./loadavg-collector.sh &
红字部分换成启动tsd服务的服务器IP和端口

vimnohup.out 可能显示-bash nc: not command found需要安装nc

yuminstall nc

每隔15秒会输出如下信息到tsd
put proc.loadavg.1m 1288946927 0.36 host=foo
put proc.loadavg.5m 1288946927 0.62 host=foo
put proc.loadavg.1m 1288946942 0.43 host=foo
put proc.loadavg.5m 1288946942 0.62 host=foo

使用浏览器登陆 192.168.145.129:4242，在from、to中选择好时间范围，在metrics里输入 “proc.loadavg.1m”，就能在图表中看到监控信息，如下图

5.总结opentsdb的表设计特点可以满足时间序列的数据存储在hbase中并能秒级相应。适合于以固定时间间隔的数据采集，例如系统软件和硬件的监控。结合logstash可以监控应用log日志信息。

附1：centos安装opentsdb

1.安装gnuplot-4.4.6：http://www.gnuplot.info/

附2：OpenTsdb的eclipse配置