miniconda安装BWA 以及miniconda的环境配置

在linux下安装miniconda首先选择清华的镜像

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
##然后在该目录下bash  该文件
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

将进入miniconda的界面如下

键入yes后，进入miniconda3的安装

但是昨天不知道为什么，我的安装一直报错，然后我今天在昨天安装的文件夹下，把安装的文件夹删除了，重新安装

报错

删除安装文件

进行下一步的重新安装

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

可以看到各个安装的包的位置

然后切换目录到miniconda3的bin

cd /root/miniconda3/bincat ~/.bashrc
查看bashrc  结果如下

然后把红框框里的路径加入环境变量,然后再执行conda

然后在此配置BWA的环境

conda  create -n wes  python=2 bwa

尽管在上面的过程安装好了miniconda3，但是在创建bwa的环境的时候，还是会报错，说当前的channels不可用。

于是在老哥的指点下，我用conda安装了bioconda，然后安装了bwa

conda install -c bioconda bwa

在此目录下，可以直接运行bwa

注意目录

miniconda安装BWA 以及miniconda的环境配置相关推荐

ubuntu18.04 安装qt5.12.8及环境配置的详细教程
这篇文章主要介绍了ubuntu18.04 安装qt5.12.8及环境配置的教程,本文通过图文并茂的形式给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下环境系统: ...
Ubuntu18.04安装OpenCV4.3.0和环境配置(支持编译CUDA并安装配置python-opencv)
Ubuntu18.04安装OpenCV4.3.0和环境配置下载源文件安装依赖编译安装环境配置动态库配置配置OpenCV的`PKG-CONFIG`环境 Python-OpenCV环境[如果安 ...
openstack官方安装文档的解析--环境配置篇（1）
openstack官方安装文档的解析--环境配置篇(1) 1. - # openstack的环境搭建安装版本的一些信息---安装的版本为queens版本,选择该版本 ...
Mac安装eDEX-UI以及后续Python环境配置
Mac安装eDEX-UI以及后续Python环境配置效果配置不想看我瞎扯可以直接跳到这环境配置思路同样适用于Linux发行版. 效果虽说macOS的界面已经十分美观了,但是对于习惯用TUI跑 ...
anaconda3安装注意事项以及pytorch环境配置
有些做法是将anaconda2和anaconda3都安装了,但我觉得没必要,因为anaconda中可以创建新的环境(python2.7和python3.7)并激活就可使用,所有选其一安装即可. 1 a ...
ubuntu16.04安装jdk以及详细jdk环境配置教程，亲测没毛病。
ubuntu16.04安装jdk以及详细jdk环境配置教程前言:此文章专为已经购买了云主机的朋友来进行ubuntu系统下的jdk配置教程.因此文中提到的xshell和xftp软件使用就直接跳过. 我 ...
mac安装jdk和maven以及环境配置
1.官网下载jdk1.8 地址: https://www.oracle.com/java/technologies/downloads/ https://www.oracle.com/java/tec ...
MAC IDEA安装与常用插件与环境配置
目录一.下载与安装IDEA 1. 下载与安装IDEA 二.安装和配置jdk 1. 安装jdk 1.8 2. 配置路径三.安装git 四.安装和配置Maven 1. 安装Maven 2. 配置Mav ...
erpnext v13 安装部署 + VSCode本地开发环境配置
ERPNext Version-13 安装生产环境参考链接 https://discuss.erpnext.com/t/install-frappe-erpnext-v13-beta-from-sc ...

miniconda安装BWA 以及miniconda的环境配置

miniconda安装BWA 以及miniconda的环境配置相关推荐

最新文章

热门文章