【PaperReading】Toward a gold standard for benchmarking gene set enrichment analysis
Toward a gold standard for benchmarking gene set enrichment analysis
- 朝着基因集富集分析基准评估的金标准迈进
- 1. 引言
- 2. 方法
- 2.1 基准汇编的构建
- 2.2 富集方法
- 2.3 基因集收集
- 2.4 运行
- 2.5 统计意义
- 2.6 表型相关性
- 2.6.1 将基因集排序转化为权重
- 2.6.2 EA排名的相关性得分
- 2.6.3 经验相关性得分分布
- 2.6.4 理论最优
- 2.7 可执行基准测试系统
- 2.8 研究产出
- 3. 结果
- 3.1 基准的范围
- 3.2 基准汇编和基因集合
- 3.3 在RNA-seq数据上的应用能力
- 3.4 运行</
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