python只保留大写字母_python - 匹配某一行并保留大写字母?
输入文件格式
C4 Alignment:
------------
Query: UN074481
Target: scaffold9929 [revcomp]
Model: est2genome
Raw score: 2379
Query range: 0 -> 510
Target range: 1114739 -> 1048547
1 : CGCACACCACACAACCACTCACGCCATGGAACACACATCACACAACCACCCACCAACTAACACATCCATGGCCACGGAACGCACACCACACAGCCACCCTCCAACACATCCATGGCCGGCGCGGGCAAGCAGGCCATCCGCGGGGGCGGGGAGCAGGGCGGCCGCACTTGGCGGAT : 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1114739 : CGCACACCACACAACCACTCACGCCATGGAACACACATCACACAACCACCCACCAACTAACACATCCATGGCCACGGAACGCACACCACACAGCCACCCTCCAACACATCCATGGCCGGCGCGGGCAAGCAGGCCATCCGCGGGGGCGGGGAGCAGGGCGGCCGCACTTGGCGGAT : 1114564
177 : GCACGAGCGGTGAGCAGGGCGGTGCCGCGGGCGGCGCCGCGGGCACGGAGCAGGGCCACCGCGCTGGCAGCGAGCTTGGCGGATGCTCGGGCGACGAGCTTGCCGGACGCGCGGGCGACGAGCATGGCGCGCAGCGGCGGCTCACTCCACCGTCGACTGCTCAGCGCAA >>>> : 346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||+-
1114563 : GCACGAGCGGTGAGCAGGGCGGTGCCGCGGGCGGCGCCGCGGGCACGGAGCAGGGCCACCGCGCTGGCAGCGAGCTTGGCGGATGCTCGGGCGACGAGCTTGCCGGACGCGCGGGCGACGAGCATGGCGCGCAGCGGCGGCTCACTCCACCGTCGACTGCTCAGCGCAAgg..... : 1114392
347 : Target Intron 1 >>>> GGGCGCGACGGATTCTTCCCTCGGGCGCGCGGCAGCCTCTTCGCTCGGGCGCGCGGTGGCATCTTTCCTAGAGCATGGCGCGTGACGGCCACTACAGAGGAGCTCCTCCCTCCGGCGTCGGCCACCCGACACTGCACTGGCGCCCGGCTGTCCC : 499
65682 bp +-||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
1114391 : ....................aaGGGCGTGGCGGCTTCTTCCCTCGGGCGCGCGGCGGCCTCTTCGCTCGGGCGCGCGGTGGCCTCTTCCCTCGAGCATGGTGCGTGACGGCCACTACAGAGGAGCTCCTCCCTGCGGCGTCGGCCACCCGACACTGCACTGGCGCGCGACTGTCCC : 1048559
500 : CCCCCCCCCCC : 510
|| || | | |
1048558 : CCTCCTCTCTC : 1048548
# --- START OF GFF DUMP ---
#
#
##gff-version 2
##source-version exonerate:est2genome 2.2.0
##date 2016-06-22
##type DNA
#
#
# seqname source feature start end score strand frame attributes
#
scaffold9929 exonerate:est2genome gene 1048548 1114739 2379 - . gene_id 0 ; sequence UN074481 ; gene_orientation +
scaffold9929 exonerate:est2genome utr5 1114395 1114739 . - .
scaffold9929 exonerate:est2genome exon 1114395 1114739 . - . insertions 0 ; deletions 0
scaffold9929 exonerate:est2genome splice5 1114393 1114394 . - . intron_id 1 ; splice_site "GG"
scaffold9929 exonerate:est2genome intron 1048713 1114394 . - . intron_id 1
scaffold9929 exonerate:est2genome splice3 1048713 1048714 . - . intron_id 0 ; splice_site "AA"
scaffold9929 exonerate:est2genome exon 1048548 1048712 . - . insertions 0 ; deletions 0
scaffold9929 exonerate:est2genome similarity 1048548 1114739 2379 - . alignment_id 0 ; Query UN074481 ; Align 1114740 1 345 ; Align 1048713 346 165
# --- END OF GFF DUMP ---
#
-- completed exonerate analysis
Command line: [./exonerate INPUT/UN183704.fa INPUT/scaffold9929.fa --model est2genome --showtargetgff TRUE --showvulgar no --showalignment yes --alignmentwidth 200 --bestn 1 --verbose 2]
Hostname: [node009]
想要匹配竖线(|)下边的行,并保留这一行所有的大写字母
最后的结果
CGCACACCACACAACCACTCACGCCATGGAACACACATCACACAACCACCCACCAACTAACACATCCATGGCCACGGAACGCACACCACACAGCCACCCTCCAACACATCCATGGCCGGCGCGGGCAAGCAGGCCATCCGCGGGGGCGGGGAGCAGGGCGGCCGCACTTGGCGGAT
GCACGAGCGGTGAGCAGGGCGGTGCCGCGGGCGGCGCCGCGGGCACGGAGCAGGGCCACCGCGCTGGCAGCGAGCTTGGCGGATGCTCGGGCGACGAGCTTGCCGGACGCGCGGGCGACGAGCATGGCGCGCAGCGGCGGCTCACTCCACCGTCGACTGCTCAGCGCA
GGGCGTGGCGGCTTCTTCCCTCGGGCGCGCGGCGGCCTCTTCGCTCGGGCGCGCGGTGGCCTCTTCCCTCGAGCATGGTGCGTGACGGCCACTACAGAGGAGCTCCTCCCTGCGGCGTCGGCCACCCGACACTGCACTGGCGCGCGACTGTCCC
CCTCCTCTCTC
python只保留大写字母_python - 匹配某一行并保留大写字母?相关推荐
- python 只取年月日 字符串_Python基础:数据类型和变量amp;字符串和编码
Python基础:1.数据类型和变量 数据类型 计算机顾名思义就是可以做数学计算的机器,因此,计算机程序理所当然地可以处理各种数值.但是,计算机能处理的远不止数值,还可以处理文本.图形.音频.视频.网 ...
- python数字转大写字母_python变量名称如何转化为大写字母?
很简单. python本身有个抽象语法树库专门解析源码.加上astor库导出到文件就可以.(如果你想用正则来解析,那就非常复杂了.所以建议来采取我的方法) 我们先思考要怎么都替换到大写字母而不影响数字 ...
- python 只取年月日 字符串_Python的数据类型
数据类型 计算机顾名思义就是可以做数学计算的机器,因此,计算机程序理所当然地可以处理各种数值.但是,计算机能处理的远不止数值,还可以处理文本.图形.音频.视频.网页等各种各样的数据,不同的数据,需要定 ...
- python 只执行一次_Python 定时任务实现只执行一次的方法
importtime # apscheduler 是第三方模块,需要 pip install 安装from apscheduler.schedulers.background importBackgr ...
- python市场饱和了没_Python的工作已经饱和?那是因为你只会Python
正如麦肯锡所说,数据已经渗透到现在的每一个行业中,成为重要的生产因素.各大公司对数据的重视度与日俱增,而随之一同增长的还有就业市场对数据分析和机器学习领域人才的强大需求. Python的热度一直居高不 ...
- python大写字母怎么表示_python – 如何在字符串中搜索大写字母并返回带有和不带大写字母的单词列表...
我的家庭作业是编写一个程序,从用户读取一个字符串,并从输入中创建一个单词列表.创建两个列表,一个包含至少包含一个大写字母的单词和一个包含其中一个单词的单词.包含任何大写字母. 使用单个for循环打印出 ...
- python判断字符串是否包含大写字母_Python:Python:如何检查unicode字符串是否包含一个cased字符?...
我在做一个过滤器,检查一个Unicode(UTF-8编码)字符串是否不包含大写字符(在所有语言中).如果字符串根本不包含任何大小写字符,我也可以. 例如:"你好!"不会通过过滤器, ...
- python获取字符串首字母_Python学习之字符串方法总结
1.首字母大写 1 test = "abcdef" 2 v = test.capitalize() 3 print(v) 2.所有字母变小写,lower()只能对ASCII 也就是 ...
- python输入文字字符串、如何提取某个汉字_python提取字符串中的汉字数字字母
原博文 2019-07-04 15:09 − #\d 匹配一个数字字符.等价于 [0-9] #\D 匹配一个非数字字符.等价于 [^0-9] #提取汉字 import re string = &quo ...
- Java黑皮书课后题第6章:*6.21(电话按键盘)国际标准的字母/数字匹配图如编程练习题4.15所示。编写一个测试程序,提示用户输入字符串形式的电话号码。程序将字母(大写或小写)翻译成数字
6.21(电话按键盘) 题目 题目描述与运行示例 破题 代码 题目 题目描述与运行示例 6.21(电话按键盘)国际标准的字母/数字匹配图如编程练习题4.15所示,编写一个方法,返回给定大写字母的数字, ...
最新文章
- C socket编程
- android实践项目一实现简单的验证码和spinner下拉选项效果
- java 编译原理 字符串_Java编译原理(javac)
- 计算机系统的工作方式,某计算机系统输入/输出采用双缓冲工作方式,其工作过程如下图所示,假设磁盘块与缓冲 - 信管网...
- Aspcms框架的webshell
- php session bug,thinkphp2.x中session的BUG及解决办法
- Linux下使用Speedtest测试网速
- android gps 案例_GPS学习要点10
- 3dmax脚本_3DMax二种距离测量方法
- Android两个控件叠在一起,如何让被挡住的控件显示出来
- 微软官方升级win10工具MediaCreationTool使用方法
- Java实现带发音的简易电子词典
- 一张图解释清楚大数据技术架构,堪称阿里的核心机密
- 计算机电路中bga是什么,什么是BGA BGA的结构和性能
- C# - 音乐小闹钟_BetaV1.0
- Aop简介 Aop术语 SpringAOP
- latex安装报错-failed: No such file or directory at G://tlpkg/TeXLive/TLUtils.pm line 1383, <STDIN> line
- 硅谷来信丨一招阻击恶意软件攻击:沙箱集成MITRE ATTCK攻击框架
- 一个荣获JOLT大奖图书的背后故事
- C语言习题:/*键盘输入两个非零整数A和B,如果A和B都是偶数则输出两个数的和,如果A和B都是奇数则输出两个数的差,如果A是奇数B是偶数则输出两数积,如果A是偶数B是奇数输出AVB结果*/