以ANSYS2020R2为例

问题一

fluent串行启动 (真串行，不是在启动界面选择的串行)是正常的，但是并行会挂，问题截图如下：

解决方案：

这个是Intel的问题，因为Fluent默认Intel的MPI并行，所以会这样。选择openmpi即可解决这个问题。设置见下图

注：如果是管理员权限运行的话，Fluent仍然

1. 前言

本文介绍了并行计算库的Hypre和Petsc的安装方法以及在线性系统求解中不同算法的性能测试，用于日后在不同系统上的Hypre和Petsc的安装需要和新型算法性能测试基准。程序安装运行环境为NVIDIA-dgx1，详细参数请见dgx1参数。本文将分为Hypre和Petsc两个部分，分别以总体介绍，安装

使用intel编译器编译VASP2020-10-31 11:00:27

之前按照sob老师的教程安装了2019的intel编译器，然而发现编译出来运算速度非常慢，原因不明，之后按照youyno老师的教程《教你从头编译vasp-5.4.1》，安装了intel编译器2015，openmpi和fftw，使用openmpi中的mpif90而不是mpiifort作为FC，编译出来的vasp速度正常了。

注意编译过程中需要海量的内存(>=64GB for -j 24)。

硬件环境

CPU: 50 cores

内存： 80GB

1. 安装依赖

yum install boost-devel libstdc++ zlib zlib-devel bzip2

2. 编译器的选择

使用GCC编译器

最新的Rosetta代码编译依赖完整的C++11特性，因此我们需要更新系统自带的

“群集”软件相对于MPI的作用是什么？2019-11-02 08:51:09

对于群集实现(“ Beowulf群集”)如何与诸如MPI之类的通信协议相关联,我有些困惑.使用类似OpenMPI的“集群”需要什么软件组件？解决方法:如您所知,群集是一堆联网的计算机.进行此类配置后,通常将安装并使用以下配置：

> MPI,用于流程之间的通信

> NFS,以使网络磁盘可见并共享给所有节点

为什么在使用mpirun -np 2 ./out命令的以下代码中出现以下错误？我在调整std :: vector的大小后调用了make_layout(),所以通常我不会出现此错误.如果我不调整大小,它会起作用.是什么原因？

main.cpp中：

#include

#include

#include "mpi.h"

MPI_Datatype MPI_CHIL

我有两个openmpi程序,我这样开始

mpirun -n 4 ./prog1 : -n 2 ./prog2

现在我如何使用MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,& size)使得我得到大小值为

prog1 size=4

prog2 size=2.

到目前为止,我在两个节目中都获得了“6”.解决方法:这是可行的,尽管有点麻烦.原则是根据argv [0]的值

我试着看看我是否可以将c代码中的数组内容发送到fortran 90代码.我正在使用使用intel 11.1.072编译器构建的openmpi 1.4.3.它们安装在Linux版本2.6.18-108chaos(mockbuild @ chaos4builder1)上(gcc版本4.1.2 20080704(Red Hat 4.1.2-48)).

这是c方面：

# include

# includ

我有一个编译时问题,我已经减少到以下测试用例.我希望从fortran调用一个C例程,让C例程知道MPI.

请考虑以下示例代码,

Fortran主要：

! -- main.f90

program main

implicit none

external return_three

integer return_three

write(*,*) return_three()

end program mai

尝试在boost::mpi tutorial中运行第一个示例时,我无法运行两台以上的计算机.具体来说,这似乎运行良好：

mpirun -hostfile hostnames -np 4 boost1

将主机名中的每个主机名称为< node_name> slots = 2 max_slots = 2.但是,当我将进程数增加到5时,它就会挂起.当我超过2台机器时,我将

我有构建环境来在Docker容器中运行代码.其中一个组件是OpenMPI,我认为它是问题的根源或表现出来.

当我使用MPI运行代码时,我收到消息,

Unexpected end of /proc/mounts line `overlay / overlay rw,relatime,lowerdir=/var/lib/docker/overlay2/l/NHW6L2TB73FPMK4A52XDP6SO2V:/var

我尝试在openmpi中使用MPI_THREAD_MULTIPLE选项.为了实现这一点,我发现我需要在openmpi配置中启用多线程选项.我不知道怎么做？有人可以帮助我.提前谢谢.我检查了系统中的openmpi设置.线程的设置如下：

Thread support: posix (MPI_THREAD_MULTIPLE: no, OPAL support: yes, OMPI prog

Centos7下安装Relion2019-06-14 15:43:05

目录

1.Virtual Box

1.1下载Virtual Box

1.2安装Virtual Box

2.Centos7

2.1下载Centos7

2.2安装Centos7

2.2.1配置虚拟机

2.2.2 安装配置系统

3.Relion

3.1下载Relion

3.1.1下载安装git

3.1.2克隆Relion

3.2配置cmake

3.2.1下载安装cmake

3.2.2下载安装mpi，fftw和fltk

3.2.3