THANATOS数据库(自噬调节相关蛋白及其翻译后修饰信息数据库)使用指南
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▌数据库概览
THANATOS数据库(THe Autophagy, Necrosis, ApopTosis OrchestratorS)收录细胞凋亡、自噬和程序性坏死调控相关蛋白及其翻译后修饰信息。
基于PubMed文献报道中4,237个实验鉴定的自噬和细胞死亡调控相关蛋白质信息,其中3,882个蛋白质来自于8个模式生物,即H. sapiens(Homo sapien, 人),M. musculus(mus musculus, 小鼠), R. norvegicus(Rattus norvegicus, 大鼠), D. rerio(Danio rerio, 斑马鱼), S. cerevisiae(Saccharomyces cerevisiae, 酵母), D. melanogaster(Drosophila melanogaster,果蝇), C. elegans(Caenorhabditis elegans, 秀隐线虫)和A. thaliana(Arabidopsis thaliana, 拟南芥)。
同时在164个真核生物中进行直系同源比对,提供某个蛋白或信号通路在不同物种之间的保守性信息,集成并整合目标蛋白已经鉴定的蛋白翻译后修饰(PTM)信息,构建凋亡、自噬及坏死相关通路蛋白调控/相互作用网络。目前,THANATOS数据库包含191,543个独特的蛋白质条目,持续更新中。
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