基于人工智能深度学习和经典算法的药物设计软件MolAICal

2024-04-10 13:41:05

使用MolAICal进行药物设计

MolAICal简介
- MolAICal 教程
- MolAICal开发版(Development version)教程

MolAICal简介

MolAICal可以通过人工智能深度学习和经典算法程序进行药物设计。

MolAICal相关信息如下：
MolAICal官方主页：https://molaical.github.io
MolAICal官方主页中国镜像：https://molaical.gitee.io
MolAICal 文章介绍：https://arxiv.org/abs/2006.09747 和 https://doi.org/10.1093/bib/bbaa161
MolAICal中文博客：https://molaical.gitee.io/cntutorial.html
MolAICal Leader and Developer：Qifeng Bai
MolAICal QQ学术讨论群： 1151656349

MolAICal 教程

0. 使用MolAICal进行分子对接
1. 使用MolAICal快速进行从头药物设计
2. 使用MolAICal的深度学习模型和经典算法程序进行GCGR的从头药物设计
3. 使用MolAICal的深度学习模型和分子对接程序进行药物的虚拟筛选
4. 使用MolAICal两步实现对Mpro蛋白活性口袋的虚拟筛选
5. 使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程
6. 使用MolAICal计算纳米管和蛋白质孔道半径的教程
7. 使用MolAICal进行药物的QSAR计算
8. 使用MolAICal软件计算Potential of Mean Force（PMF）
9. 使用MolAICal计算配体和受体结合能力的vinardo打分函数
10. 使用MolAICal计算分子合成可行性预测、类药五原则和PAINS的教程
11. 根据常数Kd, Ki, pKd或者pKi使用MolAICal计算结合自由能的操作教程
12. 使用MolAICal进行配体相似性比较或搜索的操作教程
13. 使用PyInstaller打包MolAICal软件深度学习模型“AIGenMols”的例子
14. 使用MolAICal将分子切割成片段
15. 使用MolAICal和OnionNet模型进行药物亲和力的预测
16. 使用MolAICal和Pafnucy模型对药物亲和力进行预测
17. 使用MolAICal进行分子生成和药物改造教程
18. 使用MolAICal对虚拟筛选结果进行聚类

MolAICal开发版(Development version)教程

注意：本部分教程仅适用于MolAICal的开发版本。如果MolAICal的新版本发布之后，下面的教程将移到上面，请在上面部分找到相关教程。
19. 使用MolAICal进行药物ADMET的预测和分子属性的计算

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