生信分析平台使用指导

生信分析平台打包在docker容器中，并制作出镜像，可以在评论区留言获取镜像。

1. 环境配置

鲲鹏服务器一台（或ARM64服务器一台）
安装docker（运行docker查看服务器是否已安装）

2. 启用生信发行版

初始运行命令，创建并进入docker容器。（服务器只需启动一次，无需重复启动）

sudo docker run -p 9090:8888 -e JUPYTER_ENABLE_LAB=yes -v /home/:/home/jovyan/mywork -it --user root --name mybiojupyter biojupyter:v2 bash

退出容器：exit

启动jupyter lab ,得到jupyterLab Web端地址和token，主机浏览器访问jupyterLab Web端地址

启动命令：jupyter lab --allow-root

出现如下界面，即启动成功！

JupyterLab Web端地址 : http://服务器IP:9090/token=XXXX，上图JupyterLab启动后的token=19bcc9ba2d9997c21666fe4a8c1f9dd2e30382284d51c259
浏览器截图如下图：
（原有窗口正在运行jupyterLab服务）新建窗口并从此窗口进入容器

运行命令：docker exec -it --user root mybiojupyter bash

容器内安装Ubuntu系统，可以使用系统命令随意操作，已经安装了python\R语言\conda\pip\biopython\gatk等等软件
jupyterLab简单样例介绍
进入work\biopython目录，查看jupyterLab上的biopython程序样例，如下

jupyerLab提供交互式计算环境，可以在jupyterLab的UI界面上，编写python程序、makedown文档、普通数据文本以及打开命令行界面等等

jupyterLab官方使用指导
数据上传和处理
服务器的/home/data 与容器的/home/jovyan/mywork/data 目录绑定，挂载了10T的数据盘。
只需上传数据集到服务器的/home/data目录或容器的/home/jovyan/mywork/data 目录，即可在容器内调用软件处理数据。

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2. 启用生信发行版

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