Linux系统非root下安装MPICH,【转载】如何在linux系统下安装MPICH?
MPICH已经是一个比较成熟的软件了,按照安装说明操作即可。我安装它的时候就完全是按照其文档一步一步来做的。
首先,下载安装包,我使用的MPICH2,对MPICH是兼容的,但是注意MPI2的许多功能在MPI1中是不受支持的,而很多机器装的仍然是MPI1。
然后,解压缩,找到README文件,里面有详细的安装说明。强烈建议看一遍。
第三,安装前的准备。至少你的系统要有程序编译器,因为mpich支持c/c++和fortran,因此,至少要一种编译器,常用的gcc,用来编译c,编译c++的是gxx或g++,编译fortran77的是g77,编译fortran95的是gfortran,这些我全安装了。不同系统安装命令不一样,如ubuntu是sudo apt-get install gcc,而fedora是yum install gcc,在此不多叙述。
除了编译器,你还要安装make和automake,姑且称其为工程管理器吧。虽然,后面只用到了make,但是没有automake,make的时候是会报错的。
然后就是python,版本至少是2.2以上。linux中一般是已经预装了的。
第四,配置。命令行下进入当前目录,即cd
currentDIR,然后,运行./configure。
这个耗时比较多,最后如果没有提示错误信息,就说明配置成功。如果有,那就对症下药,一般的问题是某个软件没有安装。配置的时候,可以有选项,如--prefix,这是指定安装目录的,如果不指定就会默认安装到系统目录,用管理员帐号安装即可。
第五,编译。命令make。这个耗时仍然很长,而且可以听到硬盘转动的声音,没办法,编译安装软件就是这个样子。不过,除了心痛电脑之外,我倒觉得挺有感觉的。同样,如果没有错误,就可以进行下一步了。
第六,安装。命令是make
install。安装不出错,就算OK了。
第七,最后一步,在用户主目录下新建一个文件.mpd.conf,然后加入一句SECRETWORD=pkuwwt,等号后面的字符串任意写就好了。这是为运行mpd服务的,可能与安全性有关,其权限应该设置成-rw-------,即600,命令是chmod 600 .mpd.conf。
实际上,如果不进行这一步,运行mpd的时候也会提示你的。
下面测试一下,是否安装成功,运行这样几个命令,mpd,mpirun,mpicc...,如果没有特别的错误,那就是安装成功了。
第八,现在讲一下mpd。mpd是mpi的后台程序,因此运行的时候要用mpd &,运行一次就够了。这是运行其它mpi命令的前提。实际上,对于个人电脑来说,仍然属于串行计算机,但mpich会模拟一个并行环境,即用多进程分时来模拟并行。
第九,现在可以尝试编写第一个mpi程序了。将下面的代码保存到helloWorld.c中:
#include
"mpi.h"
#include
#include
int main(int argc,char*
argv[]){
int myid,
numprocs;
int
namelen;
char
processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);
MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);
fprintf(stderr,"Hello World!
Process %d of %d on %s\n",
myid, numprocs,
processor_name);
MPI_Finalize();
return 0;
}
接下来编译并运行:
mpd
&
mpicc helloWorld.c -o
helloWorld
mpirun -np 4
./helloWorld
其中,mpd是前面讲过的后台程序,如果启动过就不用再启动了。mpicc专用来编译c程序,其它有对应的mpicxx,mpif77,mpif90。mpirun是运行命令,-np表示有几个处理器,也就是说进程数需要提前指定。
在程序中,
1)头文件mpi.h是针对c语言的,fortran是mpif.h。
2)MPI_Init和MPI_Finalize是必须调用的两个函数,任何其它mpi函数都必须在两者中间,有一个例外,是查询当前是否已经进入并行状态MPI_Initialized。最好不要在MPI_Finalize后面写什么代码,可能会出现意想不到的错误。
3)在一个程序中MPI_Init和MPI_Finaiize这两个函数只需要在主程序中调用一次,中间的子程序可以调用其它mpi函数而不需要初始化。
4)C语言中的命名规则:常数全大写,MPI和后面的第一个字母大写,其余小写。
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