生物信息学python书籍推荐_求一份学习生物信息学的书单?
看起来你们组不做种群,不做进化,不做系统生物学,可能只是用组学手段为实验方法打打基础。
关于编程,推荐四本书:
python学习手册(最基本,不用多说)
编写高质量代码 改善Python程序的91个建议(想把程序写好,基本习惯要好)
利用python进行数据分析(实际干活,panda, numpy, scipy不能少)
bioinformatics with python cookbook
python数据结构与算法分析 上面的东西学有余力想精进一下编程能力,可以看这本。之前推荐的是《大华数据结构》和许卓群的《数据结构与算法》作为高低搭配。后来找到了这本书,感觉更合适一些。所以有所修改。
关于统计学:
看概率论之前把大一的高等数学先复习一遍吧,有好处的。实验室要不要买书随意。
盛骤的概率论与数理统计,钟开莱的初等概率论。这两本是打概率论基础的。可以对照着看,钟的书没有中文版,正好和中文版的那本对照着看。钟的书里数学的味道很浓,那种从无限级数导出一个概率概念的做法很开脑洞。虽然有人不喜欢,说这样看着累,但是我觉得,数学不好的人自学时,需要这种把所有细节展示给你的方式。
陈希儒的数理统计学简史。这本是讲统计学思想的,非常难得的讲思想而不是讲方法细节的书,很适合非统计专业的人。
上面一本如果学有余力,再看就看陈希儒的数理统计学教程。注意,是学有余力的情况下。
然后,可以买来充门面的书:
Ramsay 的 functional data analysis
McCullagh 的 generalized linear models
William Feller 的 an introduction to probability theory and its applications
这本有两卷,中文版有第一卷,第二卷中文版极其难买到。如果中英对照买来就非常有(neng)面(zhuang)子(bi)了。
Karlin的随机过程初级教程,和随机过程高级教程。同样都有中文版。随机过程是种群遗传学的数学基础。如果你们实验室没有进化群体遗传学方向的研究需要,这个可以不买。
生物信息学的书其实我觉得看软件manual更合适些,推荐两本吧:
Rick Durrett 的 Probability Models for DNA Sequence Evolution
Richard Durbin 的 生物序列分析 这本也有中文版。
先想到这些。
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